variant calling--SComatic
方法来自论文:De novo detection of somatic mutations in high-throughput single-cell profiling data sets。找到需要的染色体的fa.gz文件,右击-->复制链接地址-->linux端。将以上代码段写在.sh脚本中,执行 ./ **.sh 运行即可。我的任务是在几个scRNA数据中找到在突变基因不同细胞中特异性的表达。2. 解压染色体文件,并得到染色体的.fai文件。声明:我要处理的是hg38的染色体。
原创
2024-03-26 10:41:10 ·
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