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pycharm 基础操作
李划水员
这个作者很懒,什么都没留下…
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VSCode SSH 连接 Could not establish connection to “XXX“: spawn UNKNOWN.
进入 ssh 插件的设置(可以通过在插件上选择设置按钮,也可以 ctrl + shift + p 再输入 ssh,选择 settings),在里面找到 Remote.ssh:Path 选项。默认本地路径: C:\Windows\System32\OpenSSH。拉取vscode终端:快捷键 ctrl+`(数字1旁边那个)2.1 找到本地SSH 位置。2.2 找到要修改的位置。原创 2024-04-04 10:45:06 · 674 阅读 · 0 评论 -
服务器权限:Error: EACCES: permission denied, open‘/Cardiac/uniquC.csv
我想在服务器上传一个文件uniquC.csv,但是服务器说我没有权限。1. 查看目前是否存在对文件夹的权限。这也意味着root也没有赋予写的权限。然后输入root密码。4. 查看当前的权限。原创 2024-02-26 15:16:40 · 444 阅读 · 0 评论 -
在公共服务器/集群上 安装Linux pycharm 并在窗口调出pycharm界面
1.enter the web:https://www.jetbrains.com/pycharm/download/?section=linux#section=linux2.upload software (yourself folder)3.cd software4.find the Compressed package: .tar.gz5.Decompress:tar zxf pycharm-professional-2023.2.3.tar.gz6.cd pycharm-2023.2.3/bin/原创 2023-10-30 10:43:54 · 789 阅读 · 0 评论 -
RuntimeError: CUDA error: no kernel image is available for execution on the device
RuntimeError: CUDA error: no kernel image is available for execution on the deviceOSError: /home/aita/anaconda3/envs/FusionDTA/lib/python3.7/site-packages/nvidia/cublas/lib/libcublas.so.11: symbol cublasLtHSHMatmulAlgoInit version libcublasLt.so.11 not de原创 2023-04-06 20:11:09 · 824 阅读 · 1 评论 -
已知下载链接,使用python下载数据
平常数据一般下到本地然后上传到服务器,但是内存告急,想起来之前用命令行下载数据,写了2行代码搞定。原创 2023-03-22 11:43:57 · 323 阅读 · 0 评论 -
python pd.DataFram series转ndarry,然后转为(X,1)格式
在调试代码时报错:python key of type tuple not found and not a MultiIndex原创 2023-03-20 09:17:36 · 929 阅读 · 0 评论 -
tensor与numpy、array的转换,针对RuntimeError: Can‘t call numpy() on Variable that requires grad问题
tensor与numpy、array的转换,针对RuntimeError: Can‘t call numpy() on Variable that requires grad问题原创 2023-03-08 09:09:10 · 351 阅读 · 0 评论 -
记录 No module named ‘Bio‘
安装或调用python3,biopython。python2 里面用的module是。python3 里用的module是。原创 2023-02-24 21:47:32 · 3330 阅读 · 1 评论 -
ERROR: Could not install packages due to an OSError: [Errno 2] 没有那个文件或目录
ERROR: Could not install packages due to an OSError: [Errno 2] 没有那个文件或目录: '../lib/python3.7/site-packages/numpy-1.21.6.dist-info/METADATA'找到目录也就是:/lib/python3.7/site-packages/numpy-1.21.6.dist-info,然后创建一个文件METADTATA。原创 2023-02-24 21:43:06 · 1406 阅读 · 0 评论 -
Linux导出环境包 .yaml permission deined
存在的目的是提供当前代码运行所需要的环境或者依赖信息,即这些东西的安装是当前代码运行的前提条件。这些信息相当于是开发者给使用者提供的用于恢复自己开发时的环境的信息。首先,我使用 ls -l,查看了anaconda的权限,发现权限正常,root,用户和其他都有读、写、可执行的权限。1. LInux导出环境包一般有2种:requirement.txt;然后,我发现当前路径不在代码目录下,换到代码目录下可以成功转出。4. 审稿意见涉及导出环境.yml,但是我一直permission deined。原创 2023-01-14 22:11:58 · 523 阅读 · 0 评论 -
python 获取某个字符指定字符的前面、后面和中间的字符
获取某个字符指定字符的前面或后面的所有字符内容原创 2022-08-18 15:59:03 · 11009 阅读 · 1 评论 -
python 读取.csv文件,跳过第一行的表头:drop
读取.csv文件,跳过第一行的表头:drop原创 2022-08-10 17:38:14 · 4606 阅读 · 0 评论 -
python tensorflow==1.13.1安装
python tensorflow==1.13.1安装原创 2022-08-09 14:56:30 · 3086 阅读 · 1 评论 -
二维、三维、四维矩阵每个维度含义解释
shape维度分析原创 2022-07-20 21:11:46 · 10439 阅读 · 0 评论 -
ModuleNotFoundError: No module named ‘astunparse‘
之前正常运行的代码报错:ModuleNotFoundError: No module named 'astunparse',解决方法:首先,关掉pycharm、vscode等编辑软件第二,别慌,百度什么pip不要信我pip以后报错 no attribute placeholder,后来无限循环报错。最终,我看到可能是tensorflow有问题,我用的是tensorflow==1.13.1版本,可能是软件包有问题,采用了卸载、重下,具体常规代码如下:pip uninstall tensorf原创 2022-05-05 16:32:30 · 2016 阅读 · 0 评论 -
服务器代码运行的小tips
在远程服务器跑代码时,半夜网络不稳定出现笔记本断网,且不能自动连接,而服务器在短暂断网后可以自动链接,导致代码运行终止。或者笔记本跑代码,但是可能要坐电梯一段时间没有网。我们针对这种情况,可以用screen指令。几个常用的指令如下:1)创建一个自己的screen,最好不要用数字,用字母screen -S LXX ##LXX是名字2)进去之后就是激活自己的环境啊,正常跑。然后退出这个screen用 ctrl+A当左下角有个条条闪的厉害,再+D。3)查看所有的screenscree原创 2022-04-21 10:36:36 · 646 阅读 · 1 评论 -
Kares 自注意力(self_attention)代码及Object arrays cannot be loaded when allow_pickle=False调试问题
代码来自Self attention:自注意力——Keras,IMDB 数据 - 知乎# %%import pandas as pdfrom keras import backend as Kfrom keras.datasets import imdbfrom keras.engine.topology import Layerfrom keras.preprocessing import sequencefrom matplotlib import pyplot as plt#原创 2021-12-23 16:00:34 · 795 阅读 · 0 评论 -
Kares Embedding()函数
Embedding函数的官方文档:https://keras.io/zh/layers/embeddings/输入尺寸为(batch_size, sequence_length)的 2D 张量。输出尺寸为(batch_size, sequence_length, output_dim)的 3D 张量。embedded_chars = Embedding(input_dim=sequence_length, output_dim=embedding_dim)(inputs) #embdd...原创 2021-12-23 11:14:54 · 1105 阅读 · 0 评论 -
保存多个print的输出保存为.txt文件
在服务器远程跑代码时,半夜自己笔记本断网了,所以最后看不到print,加入几行代码保存为.txt文件import sys # 需要引入的包 # 以下为包装好的 Logger 类的定义class Logger(object): def __init__(self, filename="Default.log"): self.terminal = sys.stdout self.log = open(filename, "a") # self原创 2021-12-21 14:37:18 · 393 阅读 · 0 评论 -
VScode显示无扩展,且扩展在工作区被占用
运行python代码,显示无扩展,且解释器不显示,正常在左下角刷新后面是该代码运行的环境,但是并未显示。按照软件提示,点击推荐扩展,显示被占用了 ,且安装不上方法:万能的重启...原创 2021-12-21 14:17:29 · 1394 阅读 · 0 评论 -
python 中将list输出为.csv文件&取list前几行
整理list数据使其输出为.csv,但是由于数据过大,所以现在前面截出几行,取list前5行代码为:###我的list命名为lll,取前4行lll = lll[0:4]然后调用一个pd.DataFrame转换,该方法有多个参数,这里由于我对横纵坐标没有特殊要求,所以只输出数字: lll = pd.DataFrame(data=lll) lll.to_csv('/home/LX/data_method/AC.csv',encoding='gbk')...原创 2021-12-19 20:16:35 · 1490 阅读 · 0 评论 -
bad magic number in ‘utils‘: b‘\x03\xf3\r\n‘
百度到的是在终端输入ls -a,将出现的 .pyc文件删除。但是操作后并没有出现,此时发现代码文件有一个 utils,将里面所有 .pyc文件删除,OK。总结,如果是numpy、random等已有的包,一定是 ls -a删除,如果是代码文件可以考虑删除文件里面的 .pyc!...原创 2021-12-13 09:45:15 · 1363 阅读 · 0 评论 -
Linux服务器,No module named ‘psutil‘
在报错后首先使用了pip install psutil安装失败,使用conda list查看没有改为pip install --upgrade psutilOK,get it原创 2021-12-13 09:39:57 · 2550 阅读 · 1 评论 -
将.csv合并之后,输出文件第一行是与标签数字相同的文件类型数字
在将多个.csv合并之后输出结果是添加了一行标签,其个数是dim,数据类型是文件类型,具体如下图之前的代码是import pandas as pddf1 = pd.read_csv(r'/home/LX/DNN_XGB/Dataset/csv/AAC_N1.csv', header=None)#读取第一个文件df2 = pd.read_csv(r'/home/LX/DNN_XGB/Dataset/csv/CT_N1.csv', header=None)#读取第二个文件df3 = .原创 2021-12-01 22:16:57 · 217 阅读 · 0 评论 -
pd.read_csv 输出结果第一行有数字.N的情况
在读取.csv时发现会产生第一行默认为标签的问题,导致出现下图情况这是因为pd.read_csv,读取数据时会默认第一行为列标签,并将相同的列标签重复的次数以.N的形式统计出现,解决方法是,在读取时加入参数,使第一行为非标签行。给pd.read_csv添加参数header=none即可df1 = pd.read_csv(r'/home/LX/DNN_XGB/Dataset/csv/AAC_N1.csv', header=None)#读取第一个文件...原创 2021-11-28 22:17:08 · 1436 阅读 · 0 评论 -
多个.csv横着拼接、竖着拼接
import pandas as pddf1 = pd.read_csv(r'/home/LX/DNN_XGB/Dataset/csv/AAC_N1.csv')#读取第一个文件df2 = pd.read_csv(r'/home/LX/DNN_XGB/Dataset/csv/CT_N1.csv')#读取第二个文件df3 = pd.read_csv(r'/home/LX/DNN_XGB/Dataset/csv/LD_N1.csv')#读取第三个文件file = [df1, df2, df3].原创 2021-11-21 10:35:29 · 3803 阅读 · 3 评论 -
第二次遇见:ModuleNotFoundError: No module named ‘numpy‘ 以及退出自己创建的运行环境
按照pip install --upgrade pip更新后依然报错,但是在错误开始是这样的,所以怀疑是pip的地方不对,就把ICLR虚拟环境退出,换成了base安装成功~PS:退出环境我竟然不会,百度以后都不太好用,索性用了 conda activate base(我真是个小机灵鬼)...原创 2021-11-09 15:15:13 · 255 阅读 · 1 评论 -
ModuleNotFoundError: No module named ‘numpy‘ Vscode与远程服务器
调代码报错ModuleNotFoundError: No module named 'numpy'查网上资料pip install numpy继续报错,此时确定是服务器有,所以换到最后一行指示的地址就行点击Python这一个对应找到 python版本就行,此处找的是python,不是到site-packages我的是大家可以对应找一下,就解决问题了。...原创 2021-11-08 10:58:49 · 889 阅读 · 1 评论 -
error: command ‘gcc‘ failed with exit status 1
调试ICLR:利用结构信息学习蛋白质序列嵌入报错解决方法解决: yum -y install gcc参考:CentOS安装报错:unable to execute gcc: No such file or directory - 简书原创 2021-11-06 16:02:11 · 356 阅读 · 0 评论 -
网址安装python包
在服务器创建环境安装Tensorflow发现安装版本与Python版本不符合,所以找到对应版本的网页安装包,然后加载网址安装。首先确保自己在创相应建的环境里pip install +网址网址输入应该是一个下载的链接...原创 2021-10-25 14:08:39 · 230 阅读 · 0 评论 -
本地Pycharm创建解释器环境不在C盘
在代码调试时,会想单独代码创建单独环境解释器的情况,如果是环境解释器不想放在C盘Windows+P或者在屏幕左下角右击运行,进入cmd,输入d:就进入了D盘创建代码的解释器conda create -n your_env_namepython=X.X然后进入pycharm,文件-设置-项目-解释器-添加-找到对应的环境即可...原创 2021-10-06 21:02:35 · 1163 阅读 · 0 评论 -
查看cuda、tensorflow版本
查看cudanvcc --version查看tensorflow版本pythonimport tensorflow as tftf.__version__查看tensorflow路径pythonimport tensorflow as tftf.__path__退出查看继续下面操作exit()原创 2021-09-28 20:45:52 · 343 阅读 · 0 评论 -
Conda查看环境、转换环境、查看环境包里的版本
查看当前电脑所连服务器的环境包cuda env list当前环境是红框所在,但是通常会自己创建符合自己代码的环境,用下面的代码转换环境,我这里转换到kgnn:conda activate kgnn进入kgnn代码下的环境,查看当前环境的安装包和包的版本,使用下面代码conda list在此环境下安装包conda install pip...原创 2021-09-28 20:37:24 · 7136 阅读 · 0 评论