flag:每天一点pymol
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李划水员
这个作者很懒,什么都没留下…
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Pymol 常用指令:mutation in Pymol
Pick-#73 Glu, Color->yellow, 可以看到黄色是点突变以后Trp, 红色是原来的Glu. 点击Apply保存就只剩下黄色的Trp了。点show->stick;最近想尝试突变是否会改变蛋白质结构,想起来之前安装的Pymol有蛋白质可视化功能,所以小小记录一下。可以看到,做完点突变后,周围残基并没有发生构象上的变化,意味着pymol不会自动做能量最小化处理。3. 点Wizard->Mutagenesis->protein;OK,介绍 1b27蛋白质第73个残基由E变成W的过程。原创 2024-03-18 11:18:37 · 374 阅读 · 0 评论 -
pymol--常用指令
3.还发现Pymol>后的框可以通过上↑下↓箭头会到前后指令,这与Linux是一样的。新年快乐~~~ 1.1号写了点 但是太少了没发。1. 显示蛋白质序列,点击右下角的S就可以。2. 隐藏其中一条蛋白质序列。原创 2024-01-09 16:28:42 · 431 阅读 · 0 评论 -
pymol--常用指令
1)Pymol> load name.pdb, name # 载入pdb文件,并命名,我还没试过Pymol> fetch proteinID # 直接就加载了 我用的这个右边选框,有A S H L C指令。原创 2023-12-28 10:34:43 · 663 阅读 · 0 评论 -
Pymol入门---安装Windows 多版本下载
Pymol需要文件,最好去下载清华提供的镜像,网速会很快由于我在本地有3.9的python,所以我先查了适配哪个Anaconda,然后选择在清华镜像源下载Anaconda3-2022.10的版本。下载后进行安装。原创 2023-12-28 10:21:34 · 1034 阅读 · 0 评论