关于m系列macbook下载R包xCell报错的解决方式

楼主使用的是m2 macbook，但是在最近使用过程中发现下载R包xCell出现了报错

相关代码如下

首先安装devtools

install.packages('devtools')

然后安装xCell依赖的包 

BiocManager::install(c("GSVA","GSEABase"))
install.packages('pracma', 'utils', ' stats', 'MASS',
'digest', 'curl', 'quadprog')
install.packages('Rcpp')  

以上都没出现问题，但是在安装xCell时，出现了报错，命令如下

devtools::install_github('dviraran/xCell')

报错如下

之后改成本地安装，命令如下：

devtools::install_local("/Users/liurucheng/Desktop/xCell.zip")

出现类似报错

在搜寻无果之后，询问chatgpt，得到了回复：

这个错误是由于你的系统架构与R包中的二进制文件匹配所导致的。

在这种况下，你可以试使用以下步骤来解决问题：

1. 首先，确保你已经安装了devtools包。如果没有安装，可以在RStudio中运行以下命令进行安装：

   install.packages("devtools")

2. 然后，尝试以源代码方式安装xCell包。你可以使用以下命令来安装：

   devtools::install_github("dviraran/xCell", build_vignettes = TRUE)
   #这将下载xCell包的源代码并进行安装。build_vignettes = TRUE选项将会构建包的文档，你可以根据需要调整这个选项。

3. 如果上述方法仍然失败，你可以尝试使用remotes包来安装：

   install.packages("remotes") 
   library(remotes)
   remotes::install_github("dviraran/xCell")

由于 之前我已经尝试过使用install.packages安装，但是安装失败，于是我直接使用第二种方法，但结果仍显示报错，报错内容与之前一致。

最后，使用第三种方法

install.packages("remotes") 
library(remotes)
remotes::install_github("dviraran/xCell")

提示下载成功