生物医学
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-Microbial Research -1.分享国内外top期刊的关于宏基因组,代谢组,转录组及其他组学等多组学文献的详细解读; 2.提供在宏基因组研究过程中软件安装技巧说明,生信统计方法及步骤分享;3.其它详见公众号推送
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生命早期为何影响终生菌群构建及疾病易感性
生命早期为何影响终生菌群构建及疾病易感性文献导读在出生前,肠道缺乏活菌。一旦胎膜破裂,新生儿的体表暴露于环境细菌下, 在出生后早期,微生物群表现出较高的个体间差异和较低的多样性,并受到母体接触和环境的强烈影响。持续的环境暴露稳步增加多样性,最终导致一个成熟和相对稳定的微生物群。最近的研究表明,出生后期和婴儿早期是免疫细胞成熟和稳态的一个特别重要的时间窗口。在这些研究中,出生后早期接触微生物对...原创 2018-11-12 23:59:53 · 1347 阅读 · 0 评论 -
Nature | 细菌分子靶向病毒DNA
细菌分子靶向病毒DNA文献导读为了享受美丽的环境,从苏格兰山坡到热带丛林中,我们可能需要抵御常驻害虫。如果害虫种类多,最好采取广谱防御策略(如喷洒驱虫剂)。除了拥有大量针对特定病毒的更具体的防御之外,细菌可以使用一般防御手段来对抗它们的病毒捕食者。Kronheim et al曾在nature上报导了一种抗病毒防御系统,该系统可以保护一种以上的细菌种类。这些发现可能对我们理解细菌和病毒如何...原创 2018-12-18 20:55:00 · 1279 阅读 · 0 评论 -
Aging Science| 肠道菌群与寿命的关系
肠道菌群的遗传基因构成对宿主寿命的影响文献导读近年,有关肠道菌群和宿主老化的研究越来越多。从生理角度来看,宿主体内不可缺失的一些物质是由肠道菌群所产生的,并且一些外源性的化学物质也需要通过肠道微生物的调节作用才能对宿主发挥作用。老年人体内肠道微生物组在不停地发生改变,但是有报道称通过饮食可调节肠道微生物组从而来改善其健康状况。今天呢,我就针对肠道微生物组的遗传物质构成对宿主寿命的影响来...原创 2019-01-04 20:41:01 · 1915 阅读 · 0 评论 -
你知道细菌定植的策略吗?
肠球菌如何在哺乳动物肠道中定植导读肠道菌可以定植在哺乳动物的胃肠道(GIT)中,通常与宿主健康关联。但是肠球菌也会引起宿主的一些疾病。另外,肠球菌因为其固有的和可获得的抗生素抗性,所以在用抗生素治疗期间也可以进行增殖,导致其传播产生疾病。认识到能够在GIT中定植是肠球菌感染的先决条件,引起了研究人员利用肠球菌来研究生态位定植的机制的兴趣。本综述讨论了最近研究的一些主要发现,用于了解肠球菌...原创 2019-01-10 20:10:00 · 3863 阅读 · 0 评论 -
笔记分享 | 免疫组化染色Protocol
组织脱蜡和组织清洗组织切片样本通过脱蜡处理(这里的脱蜡和HE脱蜡一样,脱至70%酒精溶液时停止,然后在流水中冲洗10 min)。10 min冲洗之后把切片放进クン酸水溶液中浸泡,クン酸用多少根据你的切片组织位置来判定(关键是要把组织全部浸泡到)。把步骤2中浸有切片组织的クン酸放在Micro wave 内加热直至クン酸溶液沸腾为止(600W的电磁炉一般3分钟即可),沸腾之后马上开始计时并且进...原创 2019-01-07 15:00:06 · 8051 阅读 · 0 评论 -
Science | 使用细胞热移位测定法鉴定嘌呤核苷磷酸化酶作为奎宁的靶标
使用细胞热移位测定法鉴定嘌呤核苷磷酸化酶作为奎宁的靶标文献导读:细胞热转变分析实验(CETSA)最初是为了帮助抗癌药物靶向研究而开发出来的方法,它是第一种广泛应用无标签方法来研究药物靶向完整细胞的方法。这项技术是根据热展开蛋白在细胞中迅速沉淀后通过监测heat challenge后剩余的可溶性蛋白来测量融化曲线的。这与使用纯化蛋白的经典热转移实验类似,配体结合通常导致蛋白稳定和熔融温度(tm...原创 2019-01-17 18:29:01 · 12436 阅读 · 0 评论 -
肺肠轴——看不见的Crosstalk
肺肠轴——看不见的Crosstalk文献导读肠道菌群是指存在于宿主肠道内的微生物,它参与了宿主多种重要的生理作用,如影响机体的营养代谢、调节机体免疫系统的发育与成熟及抗菌作用,因此肠道菌群又被人称之为"被遗忘的器官"。随着科学技术的发展,人们逐渐意识到到肠道菌群与全身各个系统的疾病的发生发展都存在着密切的关联,从而提出一些像"肠脑轴","肠肝轴"和"肺肠轴&q原创 2019-01-23 19:01:08 · 7926 阅读 · 0 评论 -
Lancet Diabetes Endocrinol | 低碳水化合物饮食对2型糖尿病患者受用吗?
Lancet Diabetes Endocrinol | 低碳水化合物饮食对2型糖尿病患者受用吗?文章导读低碳水化合物饮食作为2型糖尿病管理的策略,长期以来一直为科学界和大众所关注,但该话题仍存在很大争议。主要表现在低碳水化合物定义的差异是常见的混淆因素,就如低碳水化合物饮食处方的范围可以从生酮饮食(一般每天 <50g 碳水化合物)到食物中可含有自碳水化合物的 45 %能量。此外,包...原创 2019-01-21 18:53:15 · 879 阅读 · 0 评论 -
脑肠轴必读综述 | 肠道菌群是如何影响人的情绪疾病呢?(一)
脑肠轴必读综述 | 肠道菌群是如何影响人的情绪疾病呢?(一)导语我们先来了解下肠道微生物这个复杂的生态系统的潜力和发展。长期以来,物理学家们一直在寻求一种关于万事万物的理论,一种单一的、假设的、包罗万象的框架,用以解释和联系宇宙的所有物理方面,医学上可能在肠道微生物组中找到了自己的终极理论。人与微生物组-万物进化的新理论其实人可以看做一个超级生物体,人肠道中大约有10万亿个细菌存在,数...原创 2019-03-18 19:35:10 · 14206 阅读 · 3 评论 -
Science | 炎症性肠病和肠易激综合征肠道微生物组组成及功能变化
炎症性肠病和肠易激综合征肠道微生物组组成及功能变化文献导读炎症性肠病是一组特定的肠道慢性疾病的统称,主要包括克罗恩病和溃疡性结肠炎—维基百科肠易激综合征是一组持续或间歇发作,以腹痛,腹胀,排便习惯或大便性状改变为临床表现,而缺乏胃肠道结构和生化异常的肠道功能紊乱性疾病—百度百科文献信息英文标题:Gut Microbiota composition and functional ...原创 2018-12-27 20:52:38 · 3449 阅读 · 0 评论 -
Science | 囊性纤维化药物对肠道微生物和肠道炎症的影响
CFTR调节Ivacaftor对肠道微生物和肠道炎症的影响文献导读囊性纤维化 (Cystic fibrosis, CF) 是一种可明显缩短患者寿命的遗传性疾病。导致短寿的原因主要是因为该病患者体内的肺、小肠、胰腺导管、汗腺以及生殖腺上皮细胞的一种氯离子通道——囊性纤维化跨膜传导调节因子 (cystic fibrosis transmembrane conductance regulat...原创 2018-12-20 21:04:24 · 1127 阅读 · 0 评论 -
哺乳动物肠道微生物的传播模式
哺乳动物肠道微生物群的传播模式文献导读所有哺乳动物与细菌相关,影响宿主的消化,免疫和神经内分泌。然而,微生物群内特定细菌谱系在宿主之间传播的途径仍然知之甚小。在过去,生命进化的研究只集中在基因从父辈到子辈之间,即垂直向上传递。这一过程对于地质历史时期生命之树的发展与分化起到了非常重要的作用。再垂直的基因转移中,每个新物种全部的基因材料都源自于一个共同单一的祖先。但在横向的基因转移中,新物...原创 2018-11-11 00:20:26 · 1922 阅读 · 0 评论 -
人体内菌群如何进化适应宿主内环境
Cell:人体内菌群如何进化适应宿主环境?(综述)文献导读目前,已经有很多研究使用宏基因组技术描述微生物组在不同选择压力下所经历的菌群水平变化. 但了解菌群在这样的系统中如何进化也很重要。因此,需要考虑的是:菌群在多大程度上以特定宿主的方式进化,包括外源物质和宿主饮食等许多因素都可能使个体具有独特的选择压力,表现为特定于个体的突变特征。文献介绍英文标题: Multiscale Evo...原创 2018-11-06 06:52:21 · 3020 阅读 · 0 评论 -
胆汁酸在健康和疾病患者中与糖代谢的关系
胆汁酸在健康和疾病患者中与糖代谢的关系文献导读胆汁酸是一种两性分子(有亲水性的也有疏水性的),可以形成一种微团(Micelle),促进肠道中营养物质、脂质及亲脂性维生素的吸收、乳化和转运。最近,胆汁酸也被报道可以作为一种信号分子,参与多效应生理生化反应,比如葡萄糖和能量代谢。胆汁酸的产生和分泌可以参考我以前的分享[1],此处不再赘述。文献简介原标题:Bile acids in glu...原创 2018-11-16 19:23:15 · 11145 阅读 · 0 评论 -
粪菌移植的临床应用及其潜力
粪菌移植的临床应用与潜力文献导读FMT是将健康个体的粪便微生物转移到患病个体的胃肠道(GI)。作用机制尚未完全了解,但修复紊乱的微生物群(也称为生态失调,这是CDI发病机制所必需的)似乎是观察到的治愈效应的基础。生态失调也可能参与许多其他疾病的发病机制,如炎症性肠病(IBD),肠易激综合征(IBS),多发性硬化症(MS),肝性脑病(HE)和代谢综合征。虽然FMT似乎安全且易于执行,但应谨慎...原创 2018-11-20 11:29:05 · 8116 阅读 · 0 评论 -
Research| 细菌产生的脲酶引起克罗恩病患者的肠道菌群失调
标题:细菌性脲酶引起克罗恩病患者的肠道菌群失调导读肠道菌群组成受到很多环境因素(内外环境)的影响,如饮食、抗生素使用、肠道炎症及致病菌的侵入等;术语’dysbiosis’指的是与宿主疾病状态相关的微生物组成发生改变,也叫肠道菌群失调;一个患有IBD (溃疡性结肠炎或者克罗恩病)的病人的肠道菌群特征通常是变形菌门的菌丰度普遍更高。尽管肠道炎症可以导致肠道菌群组成发生改变,但是反过来...原创 2018-11-29 22:19:09 · 2311 阅读 · 0 评论 -
综述| 从肠道菌群”看“癌症
从肠道菌群”看“癌症导读人类肠道是一个庞大而多样的微生物群落的家园, 由大约1000种细菌组成。肠道菌群与其宿主存在共生关系, 在宿主的营养, 免疫, 代谢中起决定性作用。越来越多的研究揭示了肠道生态失调或一些特殊细菌与各种癌症之间的关联。本文将从三方面讨论:(1)肠道菌群如何诱发癌症(2)粪菌移植(FMT)如何潜在治疗癌症(3)FMT应用在癌症上的安全性一图看懂(1)肠道菌群如何诱...原创 2018-12-04 21:04:30 · 2991 阅读 · 0 评论 -
Science| 深度解析肠道菌群与肥胖
深度解析肠道菌群与肥胖文章导读肥胖导致的患病率在过去几十年中以惊人的速度增长,据估计,全球超过44%人口超重,超过3亿人受到病态肥胖的影响。肥胖是多种疾病共存的主要危险因素,包括Ⅱ型糖尿病、非酒精性脂肪肝和缺血性心血管疾病。因此,肥胖流行对人预期寿命,生活质量和保健费用有着深远的影响。那么到底是什么导致了肥胖在不超过一代人里迅速增长呢?本文是转化医学大奖得主Christoph A. T...原创 2018-11-27 20:04:41 · 11525 阅读 · 0 评论 -
人体微生物组和幼儿成长---前1000天及以后
人体微生物组和幼儿成长—前1000天及以后文献导读早期胃肠道内微生物组在免疫,内分泌,代谢和其他宿主发育途径中起关键作用,在早期发育阶段的不利环境,例如食物来源,病原菌的感染和抗生素的使用都有可能破坏这种最佳的微生物生态演替,从而导致生长和发育在整个生命过程和世代之间产生缺陷。在这里研究者评述了人类微生物组在生命前1000天的动态变化。研究者使用生长模型来描述从受孕到2岁为止过程中微生...原创 2018-12-06 20:22:05 · 2152 阅读 · 0 评论 -
脑肠轴——看不见的Crosstalk
文献导读肠道菌群是指存在于宿主肠道内的微生物集合,它参与了宿主多种重要的生理作用,如影响机体的营养代谢、调节机体免疫系统的发育与成熟及抗菌作用,因此肠道菌群又被人称之为"被遗忘的器官"。随着科学技术的发展,人们逐渐意识到到肠道菌群与全身各个系统的疾病的发生发展都存在着密切的关联,从而提出一些像"肠脑轴"和"肠肝轴"等名词。肠脑轴背景介绍据统计,定植于人体肠道内数量约是人体细胞数量的...原创 2018-12-31 21:00:33 · 19044 阅读 · 0 评论