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最新推荐文章于 2024-08-23 00:00:00 发布

探序基因

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本文链接：https://blog.csdn.net/dongxj2111/article/details/140899536

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探序基因肿瘤研究院整理

wget https://github.com/broadinstitute/gatk/releases/download/4.1.5.0/gatk-4.1.5.0.zip
unzip gatk-4.1.5.0.zip

解压缩后，文件夹里有个可执行文件gatk，还有gatk-package-4.1.5.0-local.jar

/soft/gatk-4.1.5.0/gatk AddOrReplaceReadGroups -I /xxx.sort.rmdup.bam -O /xxx.sort.rmdup.add.bam -LB library1 -PL illumina -PU pl1 -SM xxx

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