生物信息实用语言

本文介绍了Python、Perl和R这三种语言在生物信息学中的使用。Python以其简洁优雅的代码和丰富的库被广泛用于爬虫、数据分析;Perl擅长文本处理和系统管理,特别适合生物数据处理;R语言则以其强大的统计分析和绘图能力受到青睐。文中还提供了各语言的学习资源和常用库。
摘要由CSDN通过智能技术生成

一:python–life is short,I use python

维基百科对python的介绍是:Python是一种面向对象、解释型的计算机程序语言。它包含了一组功能完备的标准库,能够轻松完成很多常见的任务。它的语法简单,与其它大多数程序设计语言使用大括号不一样,它使用缩进来定义语句块。
我接触python的原因是在学习Perl语言的时候,老师时不时就会讲python不用声明变量,好方便的说;python不用花括号用Tab,好方便的说;python写代码可以调用大量的库,好方便的说。python被老师说的如此玄乎,我作为一个小萌新当然要去学学咯。
作为一个pythoner我的学习之路是这样的:语法-结构-爬虫(之后想继续学习数据分析)。因为专业不是计算机,再加上数学太low,就没去触碰算法。那现在就让我这个“过来人”介(mai)绍(nong)一下python吧。

1.1一行代码实现变量值互换

a, b = 1, 2; a, b = b, a

1.2 斐波那契数列

fibs=[0,1]
n=input(">Please enter the number you want")
for i in range(n-2):
fibs.append(fibs[-2]+fibs[-1])
print fibs
#append函数:在数组末尾加上另一个数

1.3 python常用库

urllib/urllib2/request —–爬虫请求URL需要
re —–提供正则表达式需求
numpy / scipy —–科学计算
matplotlib/ggplot2 —– 画图
scrapy/django/flask —–爬虫框架
pip —–包管理

1.4 python可以做的事

其实学了这么久,不是说什么东西就是非得去做一件事,不是说Java做软件开发就不能做数据分析,python做数据分析就不能做游戏开发。只能说尺有所短寸有所长。
爬虫:python有 scrapy/django/flask等开源爬虫框架

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