为了毕设几乎把网上能找到的光声数据集都下了一遍,坑也踩遍了,在这里整理一下,不要白费我的苦工。
小鼠脑的PAM
具体见我另一篇博客,不多说了,费劲巴拉把两百多张图片增强到5000张结果被否掉了,显微成像的维度和MRI、US都不匹配,根本用不上!电子信息跨专业来搞生医工就会犯这种愚蠢的科学性错误。
乳腺癌PAT
来源:Open data and codes for Imaging breast malignancies with the Twente Photoacoustic Mammoscope 2
链接:https://figshare.com/articles/dataset/Open_data_and_codes_for_Imaging_breast_malignancies_with_the_Twente_Photoacoustic_Mammoscope_2/22109687
论文链接:https://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0281434#pone.0281434.ref011
下载下来有4个case,里面各有2个.mat
文件,数据保存为4-D single格式,不能直接打开,在python里废了一番周折才转换成png格式,见D:\PycharmProjects\new\MRItoPA的mat2png.py
,有空再整理传上gitub吧。
直接转换成2维图像的结果是这样的,很模糊的乳腺三维扫描切片:
论文里是用来做MAP得到血管图像的(含血管增强和中值滤波处理),跑了一下里面的代码,可以得到不同方向的乳腺血管图: