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关键词:fMRI、公开数据
本期推文是 Public Neuroscience Dataset 系列主题的第三期内容。在本期推文中,我们整理了目前常用的fMRI(MRI)公开数据集。
功能性磁共振成像(fMRI,functional Magnetic Resonance Imaging)是一种神经影像学技术。其原理是利用磁振造影来测量神经元活动所引发之血液动力的改变。由于fMRI的非侵入性和其较少的辐射暴露量,从1990年代开始其就在脑部功能定位领域占有了重要地位。目前,fMRI主要被运用于对人及动物的脑或脊髓之研究中。
目前能够检索到的MRI或fMRI数据库较多,为此,编者浏览文献汇总了4大使用最广泛的数据库,希望能为大家从事与影像有关的科研工作提供帮助。
01OpenfMRI 数据库
OpenfMRI是一个以fMRI数据集为主的数据库,大多数数据集会附有使用该数据集发表的文献,无需注册或登录即可访问数据集,下载非常方便。数据集存储于ASW (Amazon Web Services),小编亲测使用浏览器默认方式下载,速度还算可观。
该数据库项目由斯坦福大学波特拉克实验室和神经可再生科学中心管理。接受美国国家科学基金会、美国国家药物滥用研究所以及约翰·阿诺德基金会资助。
- 数据库项目地址:http://www.openfmri.org
该数据库目前收录有95例fMRI(MRI)数据集,共计3372名受试者数据。由于新的基金支持以及其他原因,该数据库目前已不再更新,更新的fMRI数据集均提交至OpenNEURO。
02OpenNEURO 数据库
OpenNEURO是一个以神经科学数据为主的免费且开源的数据库,其数据集涵盖MRI,MEG,iEEG,ECoG,ASL和PET,可谓非常丰富。在上一个数据库中编者也介绍到,OpenfMRI中新的数据集也都提交到此数据库,因此,此数据库中的数据集数量之庞大,是小编也没有想象到的。目前收录有577例数据集,共计19872名受试者的数据,使用关键词fMRI检索到110多个数据集。
该数据库项目资助基金会同OpenfMRI数据库。
- 数据库项目地址:http://www.openneuro.org
数据库使用建议:
- 首次使用此数据库,建议通过一个webinar来学习如何使用。
Webinar地址:
https://www.youtube.com/watch?v=FK_c1x1Pilk - 可以在搜索栏检索关键词获取相应的数据集,如fMRI,ECoG等。
- 登录后可提交和管理自己的数据集。