结节检测流程（小记）

结节检测方法很多，但是根据luna16的描述和现阶段要复现的论文，确定接下来按如下流程进行实验。

1. 分割肺实质区域：

对CT图像进行分割，得到仅仅包含肺实质的区域。随后将原始的3D CT图像进行剪裁，得到恰能包含所有肺实质的3D 图像

 

2. 提取肺实质区域：

将CT图像和分割结果一同剪裁至最小尺寸（满足1中的要求），随后将CT图像与分割结果相乘，得到仅有肺实质，非肺实质区域值为0的3D图像。

虽然Luna16数据集有分割的数据，但是如果要做端到端的结节检测，还是需要自行添加分割部分，目前V-net和U-net经实验对肺实质的分割结果还是不错的。

 

3. 划分小方块：

剪裁后得到的3D 图像尺寸各不相同不利于计算，可以从中提取若干个3D 立方体输入到后续的网络中。网络最终输出score，可以设定一个阈值（如0.1），将低于阈值的点都抛弃，其余点则保留，作为候选结节（candidate nodule）。

 

4. 计算FROC和假阳性去除：

得到了一系列候选结节后，就可以在这些结节上计算FROC、ROC等指标。

同时根据候选结节及其对应立方体，输入到假阳性去除网络中，进行后续处理。