python网络药理学

一 什么是网络药理学

1.1 网络药理学的定义

 网络药理学是基于系统生物学的理论，对生物系统的网络分析，选取特定信号节点（Nodes）进行多靶点药物分子设计的新学科。网络药理学强调对信号通路的多途径调节，提高药物的治疗效果，降低毒副作用，从而提高新药临床试验的成功率，节省药物的研发费用。

1.2 网络药理学的应用

网络药理学能够整体地分析中药复方“多成分”的作用机制，也能独立呈现某种特定疾病相关的“活性成分-靶点-通路”，其系统性、整体性的特点与中医中药整体观、辨证论治的原则相吻合，能有效地推动中药复方的深入研究，揭示中药药效物质基础。

二 网络药理学的数据库

网络药理学的数据库成百上千种，但是我们只需要学会其中的一部分即可

 1 PubChem

https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov

2 DGIdb

http://dgidb.org/

3 DrugBank

https://go.drugbank.com/drugs/

4 ChEMBL

https://www.ebi.ac.uk/chembl/

5 CTD

https://ctdbase.org

6 TCMSP

Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform

7 ETCM

http://www.tcmip.cn/ETCM/index.php

8 TCMID

http://119.3.41.228:8000/tcmid

9 SymMap

https://www.symmap.org/

10 BATMAN-TCM

http://bionet.ncpsb.org.cn/batman-tcm/

三 为什么用python

1 python可以做数据采集，在使用数据库时不用人工操作，省时省力

2 一般网络药理学之后还需要分子对接，分子对接的pymol就是python语言的第三方库