2024-中药网络药理学-教程(全网最牛逼)

中药网络药理学-教程(全网最牛逼)

请您下载资源绑定，就可以看到了，具体的内容了

1. 首先uniprot官网下载数据

1.1. 数据下载

• 地址：https://www.uniprot.org/

• ![外链图片
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  
  ge-20240410212513022.png&pos_id=img-WfyqlIze-1713321792128)

• 我这里研究的是胶质母细胞瘤(GBM)，glioblastoma ，输入进去，然后就会得到对应的数据

• 

• 这里需要注意，不能直接下载txt文件，我们这里需要下载tsv的文件，然后进行转换为txt文件
• 

1.2. 数据整理

• 
• 

1.3. 新建文件夹[代码处理]

• 新建文件夹，命名为：1uniprot，如图所示：

• 

• 

• import pandas as pd
  
  # 读取.tsv文件
  df = pd.read_csv('uniprotkb_glioblastoma.tsv', sep='\t')
  
  # 将DataFrame写入.txt文件
  df.to_csv('ann.txt', sep='\t', index=False)
  

• 我们将文件转换为.txt的格式

• 

2. 疾病中药交集

2.1. 找到中药的复方药剂

2.1.1. 首先去TCSMP官网

• 地址：https://old.tcmsp-e.com/
• 
• 然后就需要去筛选OB,DL，OB需要>=30，DL>=0.18,如下图所示：