DSMIL-WSI 项目使用教程

DSMIL-WSI 项目使用教程

dsmil-wsidsmil-wsi: 这是一个基于PyTorch的多实例学习模型实现，用于在全幻灯图像中检测肿瘤，该模型在CVPR 2021上被接受为口头报告。项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/ds/dsmil-wsi

1. 项目的目录结构及介绍

DSMIL-WSI 项目的目录结构如下：

dsmil-wsi/
├── README.md
├── LICENSE
├── requirements.txt
├── setup.py
├── data/
├── models/
├── utils/
├── configs/
├── main.py
└── tests/

目录介绍

• README.md: 项目介绍文档。
• LICENSE: 项目许可证文件。
• requirements.txt: 项目依赖文件。
• setup.py: 项目安装脚本。
• data/: 存放数据集的目录。
• models/: 存放模型定义的目录。
• utils/: 存放工具函数的目录。
• configs/: 存放配置文件的目录。
• main.py: 项目启动文件。
• tests/: 存放测试脚本的目录。

2. 项目的启动文件介绍

项目的启动文件是 main.py。该文件包含了项目的主要逻辑和启动代码。以下是 main.py 的主要内容：

import argparse
from models import DSMILModel
from utils import load_data, train, evaluate

def main(args):
    # 加载数据
    data = load_data(args.data_path)
    
    # 初始化模型
    model = DSMILModel(args.config)
    
    # 训练模型
    train(model, data)
    
    # 评估模型
    evaluate(model, data)

if __name__ == "__main__":
    parser = argparse.ArgumentParser(description="DSMIL-WSI")
    parser.add_argument("--data_path", type=str, required=True, help="Path to the data directory")
    parser.add_argument("--config", type=str, required=True, help="Path to the configuration file")
    args = parser.parse_args()
    main(args)

启动文件功能

• 解析命令行参数。
• 加载数据。
• 初始化模型。
• 训练模型。
• 评估模型。

3. 项目的配置文件介绍

项目的配置文件存放在 configs/ 目录下。配置文件通常是一个 JSON 或 YAML 文件，用于定义模型的超参数、数据路径等配置信息。

以下是一个示例配置文件 config.json：

{
    "learning_rate": 0.001,
    "batch_size": 32,
    "num_epochs": 50,
    "data_path": "data/dataset",
    "model_path": "models/dsmil_model.pth"
}

配置文件内容

• learning_rate: 学习率。
• batch_size: 批大小。
• num_epochs: 训练轮数。
• data_path: 数据路径。
• model_path: 模型保存路径。

通过以上配置文件，可以灵活地调整模型的训练参数和数据路径，以适应不同的训练需求。

dsmil-wsidsmil-wsi: 这是一个基于PyTorch的多实例学习模型实现，用于在全幻灯图像中检测肿瘤，该模型在CVPR 2021上被接受为口头报告。项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/ds/dsmil-wsi