在医学、生物学和心理学等领域的研究中,经常需要对同一组患者在不同时间点进行多次测量,以评估某种干预措施(如药物治疗、行为疗法等)的效果。重复测量方差分析(Repeated Measures ANOVA)是一种常用的统计方法,用于分析这种类型的数据。
重复测量方差分析适用条件
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球形假设(Sphericity Assumption):不同时间点之间的协方差矩阵应该相等。如果不满足这一假设,可以使用Greenhouse-Geisser或Huynh-Feldt校正。
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正态性假设(Normality Assumption):每个时间点的测量值应该服从正态分布。
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同质性假设(Homogeneity of Variances Assumption):不同组之间以及不同时间点之间的方差应该相等。
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独立性假设(Independence Assumption):观察值之间应该是独立的。
示例代码与结果解读
假设我们有一个数据集,其中包含两组患者(对照组和实验组)在不同时间点的某项指标测量值。数据集名为repeated_measures.csv
,包含列group
(组别,'control'或'experiment'),time
(时间点,1到4)和measurement
(测量值)。
首先,加载必要的R包和数据集:
# 加载需要的包
library(ggplot2)
library(car)
# 读取数据集
data <- read.csv("repeated_measures.csv")
接下来,我们将使用Anova
函数(来自car
包)进行重复测量方差分析。在R中,通常需要使用lme4
包中的lmer
函数来拟合线性混合效应模型(Linear Mixed Effects Model),然后使用Anova
来进行方差分析。
# 安装并加载lme4包
if (!require(lme4)) {
install.packages("lme4")
library(lme4)
}
# 拟合线性混合效应模型
model <- lmer(measurement ~ group * time + (1|subject), data = data)
# 进行重复测量方差分析
anova_results <- Anova(model, type = 3)
# 打印结果
print(anova_results)
示例代码解释:
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lmer
函数用于拟合线性混合效应模型。其中,measurement
是因变量,group
和time
是固定效应,subject
是随机效应(假设每个患者被多次测量)。 -
Anova
函数用于计算模型的方差分析表。type = 3
表示使用Type III Sums of Squares,这在R的lme4
包中是默认的。
假设输出结果如下:
Type III Analysis of Variance Table with Satterthwaite's method
Sum Sq Mean Sq NumDF DenDF F value Pr(>F)
group 10.233 10.233 1 116 0.6876 0.408786
time 57.211 9.535 3 116 6.4133 0.000475 ***
group:time 14.201 4.734 3 116 3.1740 0.025902 *
---
Signif. codes: 0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1 ‘ ’ 1
结果解读:
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group
的Pr(>F)
值大于0.05,说明对照组和实验组之间在基线时没有显著差异。 -
time
的Pr(>F)
值远小于0.05,说明随着时间的推移,测量值发生了显著变化。 -
group:time
的Pr(>F)
值小于0.05,说明对照组和实验组随时间变化的趋势有显著差异,即干预措施(如果是实验组接受的)产生了效果。
最后,可以使用summary
函数来查看模型的更多详细信息,包括固定效应的估计值、标准误、t值和p值等。
# 查看模型详细信息
summary(model)
请注意,这里提供的代码和结果解读是一个简化的示例,实际情况中可能需要进行更复杂的数据处理和模型调整,以满足重复测量方差分析的适用条件。此外,在进行统计分析时,务必谨慎对待结果