GO与其它数据库见的id转换

  
GO数据库的查找和浏览FAQ 
3． 在一些模式生物中,一个基因通常有多个与之相关的核苷酸序列,如EST、蛋白序列等。要查询到这些序列，可以从该模式生物数据库中通过基因联系（gene association）查询到基因获得ID(gene accession ID),或是分别在Compugen中查询大的转录产物（transcipt）和SWISS-PROT/TrEMBL中查询蛋白。 4. 如何得到由GO术语注解的蛋白序列？ 
在GO网页上选择能查询到所有数据库的Amigo浏览器，键入GO术语（如“线粒体”），在结果中显示了被注释的基因。然后选择你所需基因，在网页的最低端把选项拖至“get fasta sequence”区域，再确定即可。 
5． 如何能够找到所有和一个特定的GO术语相关的人类基因呢？ 
GO术语是和SWISS-PROT/TrEMBL/InterPro and Ensembl中的蛋白序列无赘余地对应的。这些注释在EBI上的GOA-Human 文件中，GO的FTP站点上，Ensembl，EMBL－Bank上都可找到。 
6．可以直接使用GenBank的gi获取码在GO数据库中进行查询吗？ 
GO 数据库中除了Compugen所提供的GenBank获取码之外，没有包含其他GenBank获取码的信息，但是在EBI的GOA(GO Annotation)中，有一个综合的对GenBank/EMBL/DDBJ进行查询的方式，详细请见：ftp: //ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/GO/goa/old/HUMAN/xrefs.goa. GO与其他分类系统的定位关系（Mapping to GO） 
GO 并不只是希望为基因组建立一个标准化的、结构清晰的注释语言。GO致力于各种基因组数据库的标准化。GO为各种基因组分类系统和GO注释之间的转化提供了转化表，见http://www.geneontology.org/GO.indices.html