质控
生信学习小达人
本人专注于学习和记录自己学习生信分析过程中的知识点和报错后解决方法
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杂合度质控
对于一般自然群体,基因型个体的杂合度过高或者过低,都不正常,则需根据杂合度进行过滤。偏差可能表明样品受到污染,近亲繁殖。对于样品杂合率平均值中偏离±3 SD的个体建议删除。利用参数 --het 计算备注:杂合度--het,没有过滤的函数,只能通过编程去提取ID,然后用--remove去实现。原创 2023-05-05 21:54:21 · 179 阅读 · 0 评论 -
hwe-哈温质控
hwe原创 2023-05-05 10:50:38 · 1097 阅读 · 0 评论 -
MAF质控
MAF质控原创 2023-05-04 11:07:05 · 795 阅读 · 0 评论 -
plink缺失质控
缺失质控原创 2023-05-02 16:59:28 · 230 阅读 · 0 评论