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Perl
huangliangbo0805
这个作者很懒,什么都没留下…
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批量从NCBI后台下载指定数据的Perl脚本
最近需要在NCBI中下载所有Xanthomonas属菌株对应的gbk文件,由于NCBI前台gbk数据已经改版,故打算从后台ftp.ncbi.nlm.nih.gov下载。写了个Perl脚本用于批量下载NCBI后台数据,有这方面需求的同仁们可以参考。另外,多进程暂时未成功,后期再更改。#!/usr/bin/perl#######################################原创 2015-03-28 09:07:35 · 1078 阅读 · 0 评论 -
远程blast的Perl脚本
之前用blast2go太慢,于是自己写了个Perl脚本进行远程blast,可以将fasta文件拆分后同时运行,最后生成XML文件,可以直接导入blast2go软件,速度比blast2go-basic的快些。原创 2015-04-27 22:43:52 · 1721 阅读 · 0 评论 -
批量从NCBI后台下载指定数据的Perl脚本
最近需要在NCBI中下载所有Xanthomonas属菌株对应的gbk文件,由于NCBI前台gbk数据已经改版,故打算从后台ftp.ncbi.nlm.nih.gov下载。写了个Perl脚本用于批量下载NCBI后台数据,有这方面需求的同仁们可以参考。另外,多进程暂时未成功,后续再更改。原创 2016-03-16 18:25:14 · 3118 阅读 · 0 评论