单细胞天地复现-胃癌器官特异性转移的转录异质性（自备）

文献：Revealing the transcriptional heterogeneity of organ‐specific metastasis in human gastric cancer using single‐cell RNA Sequencing - PMC (nih.gov)

介绍

方法

使用单细胞 RNA 测序评估了来自 6 名患者的 10 份新鲜人体组织样本，包括原发性肿瘤和邻近的非肿瘤样本以及来自不同器官或组织（肝脏、腹膜、卵巢、淋巴结）的 6 个转移灶。使用组织学测定和大量转录组数据集进行验证实验。

结果

发现与侵袭特征、腹膜内转移倾向、上皮-间充质转化诱导的肿瘤干细胞表型或休眠样特征相关的恶性上皮亚簇。在包含 407 个样本的 GC 队列中，前三个亚簇相关基因的高表达比低表达基因的总生存率更差。免疫细胞和基质细胞表现出细胞异质性，并创造了促肿瘤和免疫抑制微环境。此外，还采集了淋巴结衍生的耗竭 CD8 T 细胞的 20 个基因特征以预测淋巴结转移，并在 GC 队列中进行了验证。此外，尽管即使在临床试验中，抗 NKG2A （KLRC1） 抗体也未用于治疗 GC 患者，但我们不仅发现了恶性肿瘤细胞，而且发现了一个内皮亚簇、粘膜相关不变 T 细胞、T 细胞样 B 细胞、浆细胞样树突状细胞、巨噬细胞、单核细胞和中性粒细胞可能有助于 HLA-E-KLRC1/KLRC2 与细胞毒性/耗竭的 CD8 T 细胞和/或自然杀伤 （NK） 细胞的相互作用， 提示 GC 的新临床治疗机会。此外，我们的研究结果表明，CD8 T 细胞中 PD-1 的表达可能预测 GC 中对 PD-1 阻断疗法的临床反应。

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复现

GSE163558 GEO Accession viewer (nih.gov)

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源于单细胞天地