生信脚本练习(11)随机输出5条fastq序列

该博客介绍了如何从fastq文件中随机选择序列,包括读取文件获取序列总数,随机数生成,以及按指定数量保存序列到新文件。在实践中遇到了count和count1计数不一致的问题,值得深入探讨。
摘要由CSDN通过智能技术生成

这个练习目的是从fastq文件中随机选出n条序列,输出成另一个fastq文件。
- 先把文件读一遍,看看有多少条序列,命名为count。
- 然后在此范围内取随机数
- 然后再把文件读一遍,设置一个计数器count2。遇到count2等于随机数就把序列存下来(连续存4行)。
为啥count和count1数值不一样??
count=128,count1=129???

# 8.11
# 随机选出5条fastaq序列,
# 先得知道一共有多少序列,才能做到随机取出
import random
with open('Test1.fastq') as f:
    count = 0
    while True:

        line = f.readline()
        if 
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值