如何让sra 转fastq快一点
由于之前下载的数据比较大,转fastq从财务跑了一趟回来还没转完一半,想着有没有快点的办法,人老了,心浮气躁。后来找到这个,2018年6月出来,这么久了我还没更新,可见我真的懒了很久了。
于是下下来试一下,
这边的机子是Ubuntu,就下那个吧。以前centos 和小红帽等都用过,怎么安装加载路径这里我就不说了,下次出个集合。
ls *.sra |while read id ; do fasterq-dump --split-3 -e 20 -p $id ;done
快到不要不要的
大多数的焦虑无非是难忍当下的苟且却又无力改变现状,by 小林。我现在就是这种状态