功能连接图谱

最新推荐文章于 2024-04-01 10:10:45 发布
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分类专栏： fMRI 文章标签： fMRI 核磁 数据分析
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Yeo的图谱，2011年发表，引用有2400+次
Thomas Yeo, B. T., Krienen, F. M., Sepulcre, J., Sabuncu, M. R., Lashkari, D., Hollinshead, M., … & Fischl, B. (2011). The organization of the human cerebral cortex estimated by intrinsic functional connectivity. Journal of neurophysiology, 106(3), 1125-1165.
Brainnetome atlas，2016年发表的文章，包含两个半球共246个子区域，引用290+次
官网：http://atlas.brainnetome.org/index.html
Fan, L., Li, H., Zhuo, J., Zhang, Y., Wang, J., Chen, L., … & Fox, P. T. (2016). The human brainnetome atlas: a new brain atlas based on connectional architecture. Cerebral cortex, 26(8), 3508-3526.

另外一个，2014年发布，引用390+次的
Gordon, E. M., Laumann, T. O., Adeyemo, B., Huckins, J. F., Kelley, W. M., & Petersen, S. E. (2014). Generation and evaluation of a cortical area parcellation from resting-state correlations. Cerebral cortex, 26(1), 288-303.

问题：图谱要怎么用？

GRETNA: a graph theoretical network analysis toolbox for imaging connectomics
GRTNA，神经影像的图论分析

如何画一个漂亮的功能连接矩阵图
从事脑科学核磁共振方法学研究，在Nature communications等权威期刊发表研究论文，熟练掌握磁共振处理方法和统计学方法，欢迎大家和我交流。
07-20 2997
下面将介绍一种画功能连接矩阵热力图的程序。该程序使用简单，有了改代码再也不用担心类似下图的矩阵热力图。 以下几幅图都是来自一些神经、精神、心理学的顶级期刊，包括nature medicine，nature communications、brain等。这些图是以矩热力图的形式展示的功能连接或者统计学结果图。我们可以看到属于不同的网络的节点的连接被一些网格线分割开，很容易让别人识别脑网络。 那么这种图是怎么做出来的呢？本期我们将给大家介绍一个专门用于做这种矩阵热力图的程序，并教大家如何使用改程序做出高清
基于ICA和图论方法的脑电β波静息态功能连接 (2015年)
05-26
In order to explore normal EEG beta (13~25 Hz) rhythm functional connectivity in resting state， this paper proposed an analysis algorithm which combined independent component analysis (ICA)，graph theory， hierarchical cluster analysis and standardized low-
Yeo7网络 17网络的AAL90 脑图谱的 映射关系模板
03-05
Yeo7网络 17网络的AAL90 脑图谱的 映射关系模板https://www.freesurfer.net/fswiki/CerebellumParcellation_Buckner2011 参考文献：Yeo BT, Krienen FM, Sepulcre J, Sabuncu MR, Lashkari D, Hollinshead M, Roffman JL, Smoller JW, Zollei L., Polimeni JR, Fischl B, Liu H, Buckner RL. The organization of the human cerebral cortex estimated by intrinsic functional connectivity. J Neurophysiol 106(3):1125-65, 2011
Yeo小程序组件库（v1.0）
qq_45680802的博客
02-24 178
Yeo小程序组件库（v1.0） 经过一个月左右的组件摸索，一方面是在巩固对小程序的使用，另一方面也是希望将一些实用的、有意思的组件记录下来，以便下次使用，虽然项目可能还存在许多的bug或者健全性问题，希望大家如果有发现问题，欢迎指正，欢迎交流，愿与你共同进步！ 项目地址： Yeo小程序组件库. 以下是部分组件截图： yeo-categories与yeo-category（分类） yeo-blur-card（滤镜卡片） yeo-rotate（旋转的餐盘） yeo-anima-search（动画搜索）
Yeo 17-ROI parcellation
weixin_34391854的博客
09-06 1526
Reference Buckner R L, Krienen F M, Castellanos A, et al. The organization of the human cerebellum estimated by intrinsic functional connectivity.[J]. Journal of Neurophysiology, 2011, 106(3):1125-6...
手把手教你画漂亮的功能连接矩阵图（附代码）
悦影科技
07-12 5840
《本文同步发布于“脑之说”微信公众号，欢迎搜索关注~~》 科研图片的重要性是非常重要的，审稿人看到一个低质量的或者欠美观的图片，很可能影响文章的审稿。本期我将介绍一种画功能连接矩阵热力图的程序。该程序使用简单，有了改代码再也不用担心类似下图的矩阵热力图。 以下几幅图都是来自一些神经、精神、心理学的顶级期刊，包括nature medicine，nature communications、brain等。这些图是以矩热力图的形式展示的功能连接或者统计学结果图。我们可以看到属于不同的网络的节点的连接被一些网格线分割
【茗创科技】最酷的脑功能连接图--Circos安装教程
u011661076的博客
06-22 1702
大家好，这里是 “茗创科技” 。茗创科技专注于脑科学数据处理，涵盖（EEG/ERP, fMRI,结构像,DTI,ASL, ,FNIRS）等，欢迎留言讨论及转发推荐，也欢迎了解茗创科技的脑电课程，数据处理服务及脑科学工作站销售业务，可添加我们的工程师（MCKJ-zhouyi或17373158786）咨询。你还在用这些方式呈现脑功能连接图吗？这样？ 这样？ 或者这样？ 想知道如何让自己绘制的功能连接图更好看，在一众论文中脱颖而出，吸引审稿人的目光吗？想把自己从审美疲劳中解放出来，画出像下面这样的图吗？ 那么就必
常用功能连接
weixin_40262196的博客
11-09 260
快速安装pip Windows查看CUDA版本号 CUDA官网 亲测有效 Anaconda环境安装GPU版本Pytorch WIN10下PyCharm+Anaconda+PyTorch-GPU+CUDA9.2+cuDNN7.2环境搭建 Anaconda环境安装GPU版本Pytorch python读取csv文件报错，原因是编码方式不是UTF8 ...
提取fMRI的时间序列，构建功能连接矩阵的matlab代码
06-02
步骤一： 对采集的功能磁共振成像数据进行许多预处理步骤，包括切片之间的时间校正、重新对准、图像配准、基于分割的归一化和空间平滑。需要注意的是预处理步骤的选择和顺序可能会影响最终图指标测量的范围。 ...
绘大脑发育图谱，找神经连接规律（发表在Nature期刊）
08-23
文章通过研究秀丽隐杆线虫（Caenorhabditis elegans）全脑的发育过程，利用连续切片电子显微镜技术，重建了8个不同生长阶段的同基因个体的完整大脑连接图谱。尽管大脑的整体几何结构在从出生到成年的过程中保持稳定...
基于独立成分分析和相关分析的fMRI功能连接方法关 (2008年)
06-11
利用功能磁共振成像(functional magnetic resonance imaging,fMRD技术,深人研究和探讨独立成分分析 (independent component analysis,ICA)和相关分析在功能连接方面的应用,并应用于静息状态功能连接,考察在阿尔茨海默病(Alzheimers disease,AD)的病理条件下人脑默认网络(default mode network)的异常,从而加深对AD病理机制的理解和认识。
AAL模板划分的90大脑区域.xlsx
03-29
人类脑区划分模板对应，如有侵权请联系删除。
Yeo2011_7net
10-03
Yeo2011_7net
multiAtlasTT:用于神经影像（maTT）的多图谱转移工具
05-26
multiAtlasTT（测试版） 用于神经影像（maTT）的多图集传输工具 在fsaverage空间对象空间，在这两种体积（nifti）和表面（.annot）格式;给定完成的FreeSurfer侦察-所有目录，这些脚本可以将图谱（也称为“地块划分” .annot文件）。 因此，使用这些工具，可以在主题空间5中获得多个分割（除了通常重构为1的Desikan-Killiany和Destrieux分割）。 标签传输脚本的主要部分改编自编写的脚本。 这些工具的目标是使多幅地图的装配变得容易。 玩得开心！ 这个项目是beta版; 工作正在进行中。 请随时通过发布/拉取评论发表评论。 如果您在学术工作中使用这些工具，则可以考虑。 maTT2更新（推荐） 现在，我们添加了使用FreeSurfer（.gcs）文件标记单个主题的功能。 这些文件很大，因此它们托管在此处的Figshare存储库中：
机器人专利知识图谱功能模块201907071
08-08
以下是该知识图谱的功能模块详解： 1.1 关键技术查询 用户可以输入特定的关键技术术语，系统会返回与之相关的丰富信息。这些信息包括： - 关键技术的详细介绍，可能从半结构化的在线资源（如维基百科）获取。 - ...
D3.js实现人物关系图谱有移动、拖拽、放大功能
04-28
在“D3.js实现人物关系图谱有移动、拖拽、放大功能”这个主题中，我们将深入探讨如何利用D3.js来创建交互式的人物关系网络图，并实现平移、缩放和拖拽等动态效果。 首先，理解D3.js的基础是关键。D3.js全称为Data-...
知识图谱网页应用 AXURE设计
05-29
图数据库的优势在于高效处理复杂的连接查询，这对于知识图谱应用至关重要。 3. **AXURE原型设计**：使用AXURE创建页面布局，包括搜索界面、图谱展示区域、详细信息视图等。通过交互设计，让用户能够轻松浏览、搜索...
标准化人脑分区
最新发布
cc1609130201的博客
04-01 267
使用本文提出的格式化方法,存储库的任何用户都能够找到每个图谱的来源、图谱中存在多少不同的ROI、每个ROI的位置和大小、图谱的分割与其他图谱的比较方式,以及不同图谱的ROI所覆盖的区域之间是否存在显著相关性。在这种情况下,应该使用NULL作为区域的标签。使用Neuroparc中提供的Python脚本,该脚本使用了AFNI和FSL的函数,计算了图谱对之间的Dice系数。我们的团队致力于将广泛选择的流行人脑图谱整合到一个经过策划的开源库中,在那里按照标准化协议存储它们,并附有元数据,这可以作为未来图谱的基础。
Nilearn从大脑图谱中提取时间序列及制作功能连接
clancy_wu的博客
11-08 5102
from nilearn import datasets dataset = datasets.fetch_atlas_harvard_oxford('cort-maxprob-thr25-2mm') atlas_filename = dataset.maps labels = dataset.labels print('Atlas ROIs are located in nifti image (4D) at: %s' % atlas_filename) # 4D data # One su
知识大模型如何以图谱模式进行连接
03-28
知识大模型可以通过构建知识图谱来进行连接。知识图谱是一种基于图论的数据结构，用于表示实体之间的关系和属性，每个实体都可以表示为一个节点，实体之间的关系可以表示为边。知识图谱可以将不同领域的知识进行统一的表示和连接，从而实现知识的共享和利用。 知识图谱的构建需要从多个数据源中获取数据，并进行数据清洗、建模和链接。其中，数据建模是关键的一步，需要将不同数据源中的实体进行统一的建模，确定实体之间的关系和属性。建模完成后，可以使用图数据库等工具将知识图谱存储起来，并提供查询和分析功能。 知识图谱的应用非常广泛，可以用于智能搜索、推荐系统、语义理解等领域。例如，在智能搜索中，可以利用知识图谱来识别用户的意图，从而提供更加准确的搜索结果。在推荐系统中，可以利用知识图谱来推荐与用户兴趣相关的实体。在语义理解中，可以利用知识图谱来理解自然语言中的实体和关系。
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