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LAMMPS降(升)温的几个思路
模拟降温,有大致两种办法,一个是连续(升)降温,也就是dt间隔下不停的温度下降(升);第二种方法是准静态模拟降温,每降低一个温度,跑很长时间;这两种方法大家可以根据自己情况进行模拟。对于第一种方法,只需要进行fix nvt temp 1000 100 …的设置就行了,降温的快慢,由你run N 的N来决定。对于第二种方法提供如下思路,也就是使用循环的方法(升温,降温改小参数,+改成-就行啦):...原创 2018-10-14 08:47:58 · 1983 阅读 · 0 评论 -
LAMMPS处理overlap atoms的几个命
如果我们给随机的初始条件,那么原子重叠是不可避免的。模拟的开始必须把重叠原子push开,否则模拟就无法进行了。这和能量最小化有区别,因为推开不一定能量就最小了。如何把原子推开呢,LAMMPS里大概有如下几种方面:pair_style soft command 加上 small timestep, soft style 势使系统即使原子坐标重叠力也不会无穷大,如果加上小的时间步,这样原子一次移动...原创 2018-10-14 08:49:31 · 3361 阅读 · 0 评论 -
分子动力学模拟视频
模拟小窝云课堂系列是一线科研人员(iSimuLy团队)精心制作的计算模拟技术(分子动力学、分子动力学模拟)入门和提升课程。 课程系列以引导如何自学为目标,解决学什么、怎么学的问题;课程以授“渔”为宗旨。入门课程旨在缩短新手的入门时间,降低入门的门槛,实现新人快速进入自己课题,尽量缩短发表SCI论文周期。2.模拟小窝云课堂系列是苏州爱思慕理(iSimuLy)信息科技有限公司推出的在线教育品牌。...原创 2018-10-10 10:05:42 · 4576 阅读 · 0 评论