R -- optparse()

即使R语言常常是以一种交互式的方式来运行的，但是一旦某个图形或者数据分析的流程固定下来以后，在命令行中运行就成为了一件必然的事情，optparse就可以用来实现类似在Python中的argparse一样的作用，使得我们写的R脚本可以在命令行中通过添加参数的方式来运行，同时有帮助文档可以来帮助使用者快速上手。

library（optparse）
 
option_list <- list(
    make_option(c("-f","--file"),type="character",help="输入文件"),
    make_option("--num",type="integer",default=1,help="整数"),
    make_option(c("-v","--verbose"),action=store_true,default=TRUE，help="布尔值")
    
)
 
opt <- parse_args(OptionParser(option_list=option_list))
 

这样我们就可以设置好各种参数了，然后我们可以基于参数来做一些提示内容

option_list <- list( 
    make_option(c("-v", "--verbose"), action="store_true", default=TRUE,
        help="Print extra output [default]"),
    make_option(c("-q", "--quietly"), action="store_false", 
        dest="verbose", help="Print little output"),
    make_option(c("-c", "--count"), type="integer", default=5, 
        help="Number of random normals to generate [default %default]",
        metavar="number"),
    make_option("--generator", default="rnorm", 
        help = "Function to generate random deviates [default \"%default\"]"),
    make_option("--mean", default=0, 
        help="Mean if generator == \"rnorm\" [default %default]"),
    make_option("--sd", default=1, metavar="standard deviation",
        help="Standard deviation if generator == \"rnorm\" [default %default]")
    )
 
# print some progress messages to stderr if "quietly" wasn't requested
if ( opt$verbose ) { 
    write("writing some verbose output to standard error...\n", stderr()) 
}
 
# do some operations based on user input
if( opt$generator == "rnorm") {
    cat(paste(rnorm(opt$count, mean=opt$mean, sd=opt$sd), collapse="\n"))
} else {
    cat(paste(do.call(opt$generator, list(opt$count)), collapse="\n"))
}
cat("\n")

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