WHAT‘S difference of GDCTCGA datas and TCGA datas or TCGA Pancancer altas

• 图片来自：https://ucsc-xena.gitbook.io/project/public-data-we-host/tcga

• 图片链接：https://gdc.cancer.gov/about-data/publications/HG38QC

• 通常说的GDC TCGA到底是什么？
  The NCI’s Genomic Data Commons (GDC) 数据托管平台，对数据维护和展示以及对外交流合作

  The NCI Center for Cancer Genomics (CCG) 职能部门，开展和组织研究项目

  The Cancer Genome Atlas (TCGA) CCG开展的大型癌症基因组研究项目

  Therapeutically Applicable Research to Generate Effective Treatments (TARGET) CCG开展的大型癌症基因组研究项目

  Genotype-Tissue Expression Project (GTEx) NIH开展的基因组研究项目

  TCGA dataset - - - CCG组织的TCGA项目开展过程中产生的数据。

  GDC TCGA dataset - - - CCG组织的TCGA项目完结后数据托管在GDC，此时统一了分析流程。

  PanCancer Atlas - - - CCG组织的TCGA项目完结后数据的整合性分析项目，项目包括 团队、分析的结果、发表的papers这些，所以它是一个项目。

  TCGA Pan-Cancer Atlas gene expression - - - PanCancer Atlas项目整合分析时产生的数据。

  UCSC xena data hub中的Toil RSEM gene expression - - - 这个数据是UCSC的一个团队为了将TCGA与GETx数据放在一起分析，统一了分析流程后产生数据。