JModeltest使用说明

最新推荐文章于 2024-04-17 17:29:54 发布
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   JModeltest是用于构建分子进化树时，选择合适的核苷酸替代矩阵的一个工具包，这个软件和之前的Modeltest工具包具有相同的功能，但是原来的工具还必须下载使用PAUP*，而PAUP*是一款付费软件，也就是说没有在PAUP*的情况下，Modetest无法使用。但是JModeltest的使用不需要PAUP*，因此使用起来更为方便，省下了逛论坛，求软件的痛苦历程。并且该软件用JAVA编写，能够跨平台使用。目前JModeltest里面具有11个基本的核苷酸替代模型，再加上各种参数的不同组合，一共有88种替代模型。网上有一些英文的教程，但大多还是针对Modeltest，而JModeltest使用起来更为方便，因此，趁着刚刚使用过该软件，还有些印象，把我使用的过程记录下来。

 

工具：JModeltest

下载地址：http://darwin.uvigo.es/

补充工具：Clustalx

下载地址：http://www.clustal.org/

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jiuyizhizhu
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jmeter安装
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ModelTest-NG是用于为DNA和蛋白质比对选择最合适的进化模型的工具。 ModelTest-NG通过图形和命令控制台界面在一个工具中替代了jModelTest和ProtTest。 文献资料 如果您想阅读有关使用ModelTest-NG的信息，则每个随附PDF手册。 您也可以浏览以获取在线文档，并可以浏览以查找常见错误。 引文 如果您使用ModelTest-NG，请引用以下内容： 达里巴（Darriba），波萨达（Posada），科兹洛夫（Kozlov），上午，斯塔玛塔基斯（Stamatakis），莫雷尔（M.），弗洛里（T.Flouri）（2020）。 ModelTest-NG：一种新的可扩展的工具，用于选择DNA和蛋白质进化模型。 分子生物学与进化，37（1），291-294。 doi.org/10.1093/molbev/msz189 Flouri T.，Izquierdo
Jmeter下载及安装
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qq_40240611的博客
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5、接下来还要配置classpath变量，点击新建，变量名为固定值：%JMETER_HOME%\lib\ext\ApacheJMeter_core.jar;对应的jdk版本不可太低，一般jmeter3.0的对应jdk1.7，jmeter4.0对应jdk1.8以上，否者启用jmeter也会报错。6、完成以上就说明基本配置已经完成了，最后我们可以找到我们解压的文件，点击bin目录，找到jmeter.bat, 双击打开。点击新建，输入变量名为：JMETER_HOME 变量值为你Jmeter解压的路径。
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