keepaware的博客

在生信研究中经常需要寻找蛋白序列的Domain，蛋白序列的Domain对于蛋白质来说是最重要的一部分。网页版CD-search能够解决少量蛋白序列的搜索需求，但是若是需要寻找大量的蛋白Domain信息，那么NCBI-blast+安装包携带的rpsblast绝对是最好的选择。

BLAST Database error: No alias or index file found for nucleotide database [db/dbname] in search path的可能原因

网页版BLAST的功能很强大，但是有时候使用本地版BLAST才能更方便快捷地达到我们的目的。本地BLAST的优点有很多，当查询序列很多需要进行批量BLAST或是网上没有自己需要的序列时本地BLAST就是更好的选择，并且本地版的安全性会更高，也不需要网络支持，可以自己设置BLAST数据库，因此若是需要的话可以选择使用本地BLAST，但是要注意本地BLAST建库需要的空间可能比较大。