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你大佬来啦
这个作者很懒,什么都没留下…
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python DataFrame中对行、列处理顺序的细节解析,经常搞混的可不要错过啦
本文主要介绍了python中常用的DataFrame数据结构对行和列处理的顺序,以及如何选取行、列、值的方法。原创 2021-10-31 12:10:06 · 2808 阅读 · 0 评论 -
python -m参数的含义和用法
本文介绍了python -m的使用方式和使用效果,讲解方式也比较轻松易懂,希望能帮助到有需要的人。原创 2021-01-14 23:05:24 · 8768 阅读 · 2 评论 -
想在python中查看每一行代码运行的时间?试试line_profiler吧!
在日常使用python中,新手由于经验不足总是会写下一些不成熟的代码,这些代码虽然能运行,但是却可能是非常消耗时间或CPU成本的,所以这时候一个能计算每行代码运行时间的工具就显得很有用了。本文要介绍的line_profiler就是这样的一个工具哦,快快使用起来吧!原创 2021-01-05 21:56:44 · 4624 阅读 · 2 评论 -
在linux中创建快捷方式(使用硬链接或软链接)
在windows系统中我们桌面上总会有很多快捷方式,而在linux中虽说常用命令行,但是由于某些文件或者可执行软件存放的位置较远,每次访问都需要输入较长的地址甚至还要输入绝对路径才行。那么linux到底有没有快捷方式给我们用呢?当然是有的,那就是硬连接和软连接两种方式,两种方式的作用效果不同哦。赶快学习起来吧!!原创 2020-12-17 19:13:04 · 4334 阅读 · 0 评论 -
python数据处理必会 之 pandas包中DataFrame和Series的常用方法整理
pandas是python数据处理绝对会接触到的必备包,pandas也是python中最完备的数据处理工具。pandas所包含的Series和DataFrame工具分别处理数据列及数据框,学好这两个工具就再不用担心python数据处理啦。原创 2020-08-26 22:18:12 · 969 阅读 · 0 评论 -
(python) 字符串方法整理
python字符串是一种很常用的数据类型,其拥有很多方法可进行字符串的操作,熟悉这些操作必定对数据处理或者其它工作有很大帮助。原创 2020-08-21 21:51:09 · 317 阅读 · 0 评论 -
使用Python ete3包快速大批量地寻找物种的NCBI Taxonomy分类的完整信息(物种名和Taxid可进行相互转换)
在生物信息学工作中,有时候需要将大量物种进行分类,虽说在NCBI的Taxonomy数据库能找到分类信息,但是单个寻找效率太低,数据库提供的ftp文件可读性也不高。ete3包相当于一个转换工具,用于将NCBI的分类数据进行解析,使我们能方便的获取物种或分类号的信息,在工作中必将提高工作效率。原创 2020-08-17 23:18:26 · 7770 阅读 · 8 评论 -
使用cd-hit对核酸序列或氨基酸序列聚类
cd-hit是一款用于蛋白质或者核酸序列聚类的工具,由 Dr. Weizhong Li开发,其能够很快速地对某些具有一定相似性的序列进行聚类,是现在很常用的生物信息学工具。原创 2020-08-11 23:03:35 · 8923 阅读 · 4 评论 -
linux命令行中的一些常用命令
本文简要介绍了一些常用的linux命令,相信这些基础的命令已经能处理很多常见的工作了。原创 2020-08-09 21:39:45 · 250 阅读 · 0 评论 -
python函数的一点事儿
python函数的一些事,简要介绍了python函数编写的原则,python函数包含的几种参数,以及简要介绍了函数的递归的原理,最后介绍了一下if __name__=='__main__':,有兴趣的新手朋友可以看看呀!!!原创 2020-08-05 00:33:49 · 221 阅读 · 0 评论 -
报错BLAST Database error: No alias or index file found for nucleotide database[db] in search path的可能原因
BLAST Database error: No alias or index file found for nucleotide database [db/dbname] in search path的可能原因原创 2020-07-26 15:28:05 · 11542 阅读 · 3 评论 -
隐马尔可夫模型在序列比对和基因预测中的应用
隐马尔可夫模型由马尔可夫所建立。此模型中,某个事件的发生与其前n个事件的发生情况有关,并且可以被计算出某事件发生的概率。本文章主要介绍了隐马尔可夫模型在生信中的一些应用,分别是序列比对和基因预测方面的应用。原创 2020-07-20 23:18:39 · 4982 阅读 · 0 评论 -
BLAST背后的知识(一点原理)
本文简要介绍了一下生物信息学常用的BLAST工具的基本原理和使用的算法,并顺带提了一下BLAST一般会用到的各种替换计分矩阵。希望能帮助到大家!原创 2020-07-16 00:19:24 · 5984 阅读 · 0 评论