大家好,我是小马老师。
本文分享Simon Gravelle最新案例:lammps模拟水溶液环境中的聚乙二醇(PEG)拉伸。
lammps模拟拉伸通常有两种方法:fix deform拉伸和速度拉伸,这两种方法多用于盒子的整体变形。
在本例中,PEG处于盒子中间位置,周围为水溶液环境,在PEG拉伸过程中,整个盒子的尺寸保持相对稳定。
因此,作者采用fix addforce命令对PEG链两端的原子施加方向相反的作用力,实现了PEG在水中拉伸的效果。
可到作者主页下载全部代码:
https://github.com/lammpstutorials/lammpstutorials.github.io/tree/version2.0/docs/inputs/bulkfluids/allatoms/mergePEGH2O
为方便大家学习参考,对in文件进行了注释
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