lammps蒙特卡洛MC模拟案例

大家好,我是小马老师。
本文介绍lammps和蒙特卡洛(MC)相结合的模拟方法。
MC是一种随机模拟方法,可以模拟一定区域内的随机原子交换过程。在lammps中,和MC相关的模拟命令有三个:fix gcmc、fix atom/swap、fix sgcmc。
本文主要介绍fix sgcmc命令。sgcmc命令可应用到合金的模拟中,如短程有序模拟。
fix sgcmc语法格式:

fix ID group-ID sgcmc every_nsteps swap_fraction temperature deltamu ...
  • ID, group-ID:fix命令的id和原子组的id sgcmc:该命令的关键词 every_nsteps:每隔every_nsteps步执行一次MC循环
    swap_fraction:每一个MC循环周期内执行的交换步数的比例
    temperature:MC循环中的温度,通常这个温度与MD模拟的温度相同 deltamu:化学势差

在一个lammps模拟中,mc和md可同时存在,间隔运行,所以设置fix sgcmc命令的同时,可以同时设置系综(nve、nvt或者npt)。
如:

fix mc all sgcmc 50 
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LAMMPS(大型原子/分子并行仿真器)是一个用于原子/分子系统的可扩展的分子动力学模拟软件。在LAMMPS中,除了分子动力学(MD)模拟外,还可以使用蒙特卡洛MC)方法进行模拟蒙特卡洛吸附是一种通过模拟空气中气体分子在固体表面吸附的现象来研究吸附过程的方法。在LAMMPS中,可以使用MC方法来模拟蒙特卡洛吸附。下面将以吸附氢气分子在金属表面上的实例进行说明。 首先,需要定义表面和气体分子的力场参数,并设置模拟的温度和压力。然后,在模拟开始时,将金属表面的各个原子位置确定,并随机在表面上选择一个吸附位点。然后,从气相中选择一个氢气分子并在吸附位点进行吸附。在模拟中,将进行一系列的MC步骤,通过随机改变氢气分子位置以及在金属表面扩散的概率来模拟吸附和扩散过程。每个MC步骤后,通过计算系统的能量和吸附分子的位置来确定模拟系统的状态。模拟过程中通常会记录吸附分子的覆盖度、吸附在不同位点的分子数以及吸附分子的扩散系数等信息。 通过多次重复模拟可以得到吸附过程的统计信息,比如吸附等温线(吸附覆盖度与压力的关系)和吸附分子扩散动力学等特性。这些信息可以帮助研究人员理解和预测吸附过程中的相互作用、吸附能和扩散动力学等重要参数,并为设计吸附材料或优化吸附分离过程提供指导。 总之,LAMMPS中的蒙特卡洛吸附实例是通过模拟气体分子在金属表面上的吸附和扩散过程,通过一系列的MC步骤来模拟吸附过程,并得到吸附等温线和扩散动力学等统计信息,以便研究和优化吸附过程。
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