lammps教程:Compass力场设置方法

大家好,我是小马老师。
本文介绍lammps compass力场的设置和建模方法。
compass力场在ms中用的比较多,但是在lammps中用的较少,因为很多参数不是公开的,限制了这个力场的应用范围。
本文以聚乙烯为例,介绍compass力场的设置方法。
(1)在ms中使用AC模块建一个包含10个链的聚乙烯模型,力场选择compass力场
在这里插入图片描述

(2)导出car文件,使用msi2lmp进行转换。
compass力场和pcff力场类似,对应的转换类型为2(或II),因此,msi2lmp转换命令为:

msi2lmp PE -class II -frc compass_published -i>data.pe
### 如何在 Material Studio 中配置和应用 Compass II 力场 #### 配置Compass II力场 为了在Material Studio中使用Compass II力场,需先确认所使用的版本支持该特定力场。通常情况下,在安装或更新软件时可以选择加入额外的力场包[^1]。 一旦确保环境已准备好,则可以在构建模型之前通过以下方式指定力场: - 打开Materials Visualizer并加载所需的分子结构文件。 - 利用Build模块下的功能创建新的化学物质或者修改现有实体。 - 当完成初步设计之后进入Properties窗口,找到Forcefield选项卡。 - 下拉菜单中选择“COMPASSII”,这一步骤会自动调整所有必要的参数以匹配选定力场所需条件[^2]。 对于更复杂的体系如交联聚合物,可能还需要编写Perl脚本来辅助生成初始构型,并确保这些特殊连接能够被正确识别与处理[^3]。 #### 应用实例:聚乙烯建模 具体到聚乙烯这类高分子化合物的例子上,可以通过如下流程来实现基于Compass II力场的研究工作: - 使用Amorphous Cell (AC) 工具快速生成含有多个重复单元组成的无定形固体样品。 - 设置数目为十个链长度不等但平均分布的空间排列形式作为研究对象的基础框架。 - 接下来切换至Forcite Plus界面执行几何优化过程;这里推荐采用Smart算法以获得更加精确的结果[^4]。 ```python from materials_studio import ForcitePlus # 假设已经有一个名为polyethylene_model的对象代表上述建立好的聚乙烯模型 optimizer = ForcitePlus() optimized_structure = optimizer.optimize_geometry(polyethylene_model, method='smart') ```
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