Common cortical abnormalities across neuropsychiatric disorders

传统的case-control比较，关注的主要是同一类疾病的大脑异常，最近一系列的研究都表明在多种疾病存在共同的皮层异常。本文将简要梳理一部分研究中与MRI相关的结果。

文献1‍

该研究主要就是做相关并且做了spin-test。不过在SCZ/BD/MDD的基础上加入了22q，除了常见的CT和SA还考察了SV和FA。作图使用SCZ的效应量作为基线，说明他们关注的点是SCZ和其他疾病的对比。结果表明跨精神疾病的皮层测量的效应量的模式类似，体现了其共同遗传基础，并且与SCZ和BD的共同遗传风险和大脑结构表型一致。

Subcortical Volume

Cortical Thickness

Surface Area

Fractional Anisotropy

文献2

该研究分析了EPI/ASD/ADHD/MDD/BD/SCZ几种disorders的41个region，可以发到Molecular Psychiatry的原因大概是还做了genetic的overlap，在文献4中也做了几乎一样的分析。

文献3

该研究考察了ASD/ADHD/MDD/OCD/BD/SCZ几种疾病，不一样的是他们对几个case-control结果做了PCA。

之后就是对PC1做一堆相关，包括Microstrcutraul Gradient， Functional Gradient， Virtual histology (Big Brain)， PET maps。

文献4

该研究首先做的是cell-type基因表达和effect size maps的相关，发现某些cell-type似乎都和这些疾病展现出的皮层异常有关(注意：由于统计上有未控制的因素，一部分结果可能是false positive)。他们最近几天在BP发了一个类似的文章做的是surface area。

之后对effect size maps做PCA得到PC1

文献5

这个文章对几种疾病做了一个EFA找潜在的模式，EFA几乎就是照着SPSS教程做的，因子提取方法用了PCA，Rotation用的是Oblique。

1. 做correlation，没有做spin-test是硬伤，显然作者不太熟悉R，连label的颜色都没改。

2. 用SPSS做了EFA，可以看到development相关的disorder和F1相关较低。

3. 既然找到了共同的latent factor，那么就计算一下每种disorder的deviation吧。其实就是用F1预测原始的effect size，其residual就是deviation。这个值越高说明无法被共同的F1解释。

文献6

该研究考察了BD/ADHD/ASD/MDD/OCD/SCZ几种疾病，首先做了Co-alteration Network和Epicenter分析，之后做了Gradient分解得到G1和G2主轴，随后一系列后续分析。研究结果表明，疾病的影响是以同步的方式并沿着多层次的皮层组织发生的。这样的主轴可以帮助了解精神疾病的不同神经生物学途径。第二作者是ENIGMA-TOOLBOX的开发者，因此大部分操作源于此工具包，另外一部分操作源于该组另外一个工具包BrainStat。

Co-alteration和Epicenter示意图👇

简单说就是把几个effect size map当作被试，对region做相关，算下degree centrality就得到co-alteration hubs，之后和已有的rsFC/DTI得到的模式，做相关得到epicenter。

对region之间的相关做一个Gradient分解得到G1和G2后，再做一系列后续分析(C/D/E/F)。

文献7

该研究考察了22q/ADHD/ASD/EPI/MDD/OCD/SCZ/BD/PD等几种疾病，由于他们那里就是EPI的工作组，所以还对分别纳入了EPI的三种类型。增加了分子水平的易感性(包括基因表达、神经递质密度、新陈代谢和髓鞘化)和连接水平(连接数、中心性和连接多样性)的易感性，发现具有类似注释(annotation)的大脑区域在不同的疾病中受到类似的影响。

该文章在几篇preprint中质量较高，从形式上来看，是做过排版的preprint，而且大部分图片采用了同一色系的配色，在分析方面有独到的地方，比如SC-informed abnormality将连接的权重考虑在regional abnormaity中，计算epicenter likelyhood等，一些补充分析也可以看出研究者考虑到了某些潜在混淆因素。

用的就是以下这些maps

首先做一个线性模型，看一下哪些feature和effect size maps相关。

之后对region做相关，发现具有类似分子注释(annotation)的大脑区域在不同的疾病中受到类似的影响，也就是disoder-similarity vs. other-similarity有相关的关系。

值得一提的是在补充分析中作者做了一个leave-one-out的区域相关分析，在一定程度上说明了得到的疾病相似性矩阵是稳定的。

小结，这些文章大部分都属于基于已有的effect size map的secondary analysis，很多因素都无法加以控制。比如，之前文章使用的模型不统一，疾病之间存在Comorbidity，疾病中的heterogeneities等。这些研究只提供insight，是否可靠仍有待检验。

Refs

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Hettwer, M. D., Lariviere, S., Park, B. Y., van den Heuvel, O. A., Schmaal, L., Andreassen, O. A., ... & ENIGMA Schizophrenia Working Group. (2022). Coordinated Cortical Thickness Alterations across Psychiatric Conditions: A Transdiagnostic ENIGMA Study. medRxiv.

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