导入pyBigWig包

今天复现论文时，看到了一种叫做bigwig格式的数据，创建和访问该格式文件需要用到pybigwig包，在此过程中遇到了一些问题，记录一下。

介绍

pybigwig的使用依赖于两个C库，所谓C库就是C语言编写的python库。

正如在pypi官方的python软件包仓库中介绍：

安装步骤

所以我们在激活所需安装的虚拟环境后，再安装这两个C库：

1.安装 libcurl 和 curl-config：

• 使用以下命令安装libcurl和curl-config：

  conda install -c conda-forge libcurl

• 这将从conda-forge通道安装libcurl和curl-config。

2.安装 zlib：

• 使用以下命令安装zlib：

  conda install -c conda-forge zlib

• 这将从conda-forge通道安装zlib。

3.安装pyBigWig包

使用 conda 或 pip 来安装 pyBigWig 包。pyBigWig 并没有官方的 conda 包，所以通常通过 pip 安装:

pip install pyBigWig

这里请注意，这里的安装请在linux环境下进行安装！

然后我这里安装的时候是在windows下进行安装的，所以出现了以下报错：

所以我改到了linux系统下使用同样的方式进行导入：

成功了！

这是因为pybigwig只有linux系统下的版本pyBigWig ·PyPI