RNA-seq(2):下载参考基因组及基因注释，及测序数据-学习笔记

今天学习了如题的一些操作。但是并不算成功。本来打算做到quality control，结果大部分时间卡在了下载测序数据上。

参考网站：
下载参考基因组及基因注释）

1.安装ASPERA
1）wget http://download.asperasoft.com/download/sw/connect/3.7.4/aspera-connect-3.7.4.147727-linux-64.tar.gz
2)tar zxvf aspera-connect-3.7.4.147727-linux-64.tar.gz

3）bash aspera-connect-3.7.4.147727-linux-64.sh
4）cd /home/name # 去根目录
5）ls -a # 如果看到.aspera文件夹，代表安装成功
6) export PATH="~/.aspera/connect/bin:$PATH"
7) source ~/.bashrc

2.sra数据下载(采取aspera下载）

cd  /mnt/f/Data/chip_seq/data
for ((i=204;i<=209;i++));do ascp -QT -v -i ~/.aspera/connect/etc/asperaweb_id_dsa.openssh -k 1 -T -l200m anonftp@ftp-private.ncbi.nlm.nih.gov:/sra/sra-instant/reads/ByRun/sra/