单细胞测序数据分析（1）—数据下载

最新推荐文章于 2024-06-07 17:36:09 发布
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分类专栏： 生信分析
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本文链接：https://blog.csdn.net/leo12354/article/details/108436170
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参考：
单细胞实战(一)数据下载
参考链接里主要是下载了一篇文章里提及到的两个患者单细胞数据分析集，

第一个患者：
SRR7722937
SRR7722938
SRR7722939
SRR7722940
SRR7722941
SRR7722942
第二个患者：
SRR7692286
SRR7692287
SRR7692288
SRR7692289

下载的方式，有两种，
第一种，采用ASPERA下载，我的RNA-seq学习笔记中有这个软件的下载和安装，这儿省略介绍此步骤。

export PATH="/home/leo/.aspera/connect/bin:$PATH"
source ~/.bashrc
ascp -QT -l 500m -P 33001 -i /home/leo/.aspera/connect/etc/asperaweb_id_dsa.openssh era-fasp@fasp.sra.ebi.ac.uk:/vol1/fastq/SRR772/000/SRR7722940/SRR7722940.fastq.gz .

但是，结果很不辛，提示报错

Session Stop  (Error: Session initiation failed, read timed out)

我尝试用下面的方

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leo12354
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