今天,终于学会了之前看上去很神奇的ID转换。之前分析RNA-seq数据结果之后,拿到的结果很让我烦躁,因为,如图。
我怎么知道那个ID是个什么基因?于是乎,我就搜索。
用到了biomart,这个ensmbl网站上的一个工具。大致流程可以参考下面链接:
基因转换小工具很实用
批量转换基因名教程
biotools
比对着教程,做了一点操作,但是感觉很繁琐,而且,最后的结果和原来CSV文件里的顺序是不一样的,截图如下:
这样受到了限制,因为一次性最多500个基因名,那么我要是有1500个,我要分三次检索,整个过程还算可以忍受,但是,我要比对上原来的gene_id,就要一个个去找,这样太麻烦了,我中间真的想要放弃