Lnc2cancer 3.0，lncRNAs和circRNAs数据更新及分析工具使用指南

Lnc2Cancer 3.0是更新版本，该数据库主要存储包括实验支持的人类癌症相关的长非编码RNA (lncRNAs)和环状RNA (circRNAs)与相关数据。也包括通过高通量RNA测序技术（RNA-seq）和单细胞RNA-seq（scRNA-seq）分析lncRNA表达的工具。

 

Lnc2Cancer 3.0更新了几个新的特征：

（1）增加了肿瘤相关lncRNA数目，目前的版本包括9254个lncRNA-癌症关联条目，其中涉及2659个lncRNA和216个癌症亚型；

（2）新增加了1049个实验支持的与癌症相关的circRNAs，其中涉及743个circRNAs和70个癌症亚型；

（3）提供实验支持的癌相关lncRNAs和circRNAs调控机制，涉及microRNAs、转录因子（TF）、遗传变异、甲基化和增强子；

（4）补充了实验支持的癌症相关lncRNAs和circRNAs的生物学功能，包括细胞生长、凋亡、自噬、上皮间充质转化(EMT)、免疫和编码能力。

（5）提供实验支持的癌症相关lncRNAs和circRNAs在转移、复发、循环、耐药性和预后方面的临床相关性。

 

此外，Lnc2Cancer 3.0还开发了两个在线工具，包括RNA-seq和scRNA-seq web工具，以实现对癌症中lncRNAs的快速、可定制的分析和可视化。Lnc2Cancer 3.0是一个对于阐明lncRNA、circRNA与癌症之间的关系有价值的资源。

 

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