平静地发癫-CSDN博客

原创 linux批量修改统一格式的文件名

【代码】linux批量修改统一格式的文件名。

2024-03-28 23:05:24 202

原创根据fastp结果json批量提取质控后的claean reads/Q30/GC content

【代码】根据fastp结果json批量提取质控后的claean reads/Q30/GC content。

2024-03-27 08:09:57 506

原创 R 批量计算基因的内含子位点

有时候设计引物需要跨内含子，一个基因在CDS多的情况下或者有多个基因在设计引物的时候都需要跨内含子，这时候手动计算会很麻烦会很麻烦，因此本文利用，即可得到所有基因的内含子位点。在代码之前需要理解基因结构，方便理解代码。

2024-02-05 21:58:21 464

原创 R花瓣图(flower plot)绘制

【代码】R花瓣图(flower plot)绘制。

2024-01-30 20:55:43 684

原创 R循环处理同类型文件

【代码】R循环处理同类型文件。

2024-01-30 20:21:57 182 1

原创 UpSetR基础绘图

【代码】UpSetR基础绘图。

2024-01-30 20:15:05 245 1

原创 R circlize基础绘图

【代码】基因组圈图。

2024-01-10 16:08:52 122

原创 CMpolt基础绘制snp密度图

【代码】CMpolt绘制snp密度图。

2024-01-10 16:06:04 583

原创 linux 对同一类型文件批量循环处理，两种方式

【代码】linux 对同一类型文件批量循环处理，两种方式。

2024-01-08 16:40:28 508

原创 R 2种方法绘制云雨图（半小提琴+箱线+散点）

来源参考如下，并进行一些修改。

2024-01-07 18:01:03 1651 1

原创 R ggplot2 对同一类型文件批量循环画图

【代码】R ggplot2 对同一类型文件批量循环画图。

2024-01-07 15:49:55 615 1

原创 awk 使用记录——自留(不定时更新)

【代码】awk 使用记录——自留(不定时更新)

2024-01-07 15:19:21 557 1

原创 VennDiagram多元韦恩图---以3元和5元为例

【代码】VennDiagram三元韦恩图---基础绘图。

2023-12-29 18:46:50 664

原创 seqkit 对fasta文件的各种操作

【代码】对fasta文件的各种操作。

2023-12-29 17:04:13 1551

原创 linux centos更新java版本全记录

【代码】linux centos更新java版本全记录。

2023-12-29 16:10:47 638

原创 Linux - for嵌套循环

已知有ABC三个物种叶片的TPM，每个物种有3个生物学重复，每个生物学重复有10个TPM，如下所示。但是每个生物学重复里有10个样本，一遍一遍敲代码太累，可以用循环解决。现在想把文件进行合并，如下所示。ABC也可以循环进去，嵌套进去。

2023-12-26 16:45:04 454

原创 ggplot散点图+对数曲线拟合

【代码】ggplot散点图+对数曲线拟合(从0开始或从第一个点开始)

2023-12-26 16:07:02 1006

原创 ggalluvial ggplot2桑基图基础绘制

【代码】ggalluvial ggplot2桑基图基础绘制。

2023-12-14 08:41:55 657

原创 ggplot 小提琴+箱线基础绘图

【代码】ggplot 小提琴+箱线基础绘图。

2023-12-08 09:42:24 466

原创 sed使用记录——自留(不定时更新)

【代码】sed使用记录——自留(持续更新)

2023-12-04 14:04:15 381

原创 MCScanX和RIdeogram—同物种不同品系间共线性分析与可视化

coverage 即 (query.end - query.start +1 )/query.length ≥0.8。染色体编号须为数值，起始关系根据A_B.collinearity和gff文件可以提出。具体结果在这里有详细说明。

2023-12-03 18:21:34 2161

原创 Linux uniq去重复、保留重复、查看重复次数

【代码】Linux uniq去重复和保留重复。

2022-11-20 12:58:58 650

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