相似性

博客探讨了语义相似性的概念,强调了它在生物医学领域的应用,如基因和蛋白质功能的比较。文章介绍了几种计算相似性的方法,包括Jaccard相似性、高斯相似性和余弦相似性,其中Jaccard系数通过测量交集与并集的比例来评估相似性,而余弦相似度则通过向量的夹角余弦来度量相似程度。
摘要由CSDN通过智能技术生成

拓扑相似性


语义相似性(semantic similarity)定义在一组文档上或者术语上的度量,他们之间的距离基于他们的意义或者语义内容的相似性,而不是语法表示上的相似性。我们可以通过定义拓扑相似性来估计语义相似性。

生物医学上的应用:它们主要用于比较基因和蛋白质的功能相似性,而不是它们的序列相似性,但它们也正在扩展到其他生物实体,如化合物,解剖实体和疾病等方面。

常用来计算相似性:

1.jaccard 相似性:Jaccard指数也称为交集交汇点和Jaccard相似系数(Paul Jaccard最初创造的系数),是用于比较样本集的相似性和多样性的统计量。 Jaccard系数测量有限样本集之间的相似性,并将其定义为交点的大小除以样本集的并集大小:如果AB都是空集的话,也定义为J(A

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