一文学会制作R包

R语言小巧精悍，能在多个平台上快速安装，具有众多的统计包，能快速画出还算美观的图（推荐ggplot2）,因此在编程语言的舞台上占有一席之地。

对于生物狗来说，主要用下面两种方式来安装R包：

1，

install.packages()

2，

source(“https://bioconductor.org/biocLite.R”)
biocLite()

用别人的包很爽，自己开发一个也很有趣，下面来谈谈步骤：

1, 编写R function （R有S3，S4和RC三种模式，我们最开始接触R时学的data.frame, matrix, vector等都是基于S3模式）。

Note: 在编写函数是一定要考虑R的向量化，充分向量化，就不用Rcpp来加速了（我曾经遇到过用C++来改写R代码后速度没有改善的悲剧）。

2，在Rstudio中开一个R package的project（在命令行自己编译也可以，Rstudio能省很多事），怎么用Rstudio？问google。

3，用roxygen2创建.Rd文档和NAMESPACE文档，用devtools::create_description()来创建description文档（下文Reference有链接）。

4，将编译好的包传到github上去，以便其它人能安装使用（见Reference）。

References

Introduction to roxygen2
Package namespace
Putting your R package on GitHub