化学结构式检索obabel

1、mol文件追加到检索库sdf

 

 

2、生成索引文件fs

 

babel default1.sdf -ofs

 


 

3、精确检索

Smiles;inchi;

两个格式结果等同,但Smiles效率应该略高,采用的索引。

 

Smiles:

Babel search.mol -osmi

 

obabel default1.fs -O out.svg  -s c1c(ccc(c1)[N+](=O)[O-])N exact

3个结果。

 

 

 

Ex:

babel "G:\default1\def

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