Python机器学习库scikit-learn实践

Python机器学习库scikit-learn实践

zouxy09@qq.com

http://blog.csdn.net/zouxy09

 

一、概述

       机器学习算法在近几年大数据点燃的热火熏陶下已经变得被人所“熟知”,就算不懂得其中各算法理论,叫你喊上一两个著名算法的名字,你也能昂首挺胸脱口而出。当然了,算法之林虽大,但能者还是有限,能适应某些环境并取得较好效果的算法会脱颖而出,而表现平平者则被历史所淡忘。随着机器学习社区的发展和实践验证,这群脱颖而出者也逐渐被人所认可和青睐,同时获得了更多社区力量的支持、改进和推广。

       以最广泛的分类算法为例,大致可以分为线性和非线性两大派别。线性算法有著名的逻辑回归、朴素贝叶斯、最大熵等,非线性算法有随机森林、决策树、神经网络、核机器等等。线性算法举的大旗是训练和预测的效率比较高,但最终效果对特征的依赖程度较高,需要数据在特征层面上是线性可分的。因此,使用线性算法需要在特征工程上下不少功夫,尽量对特征进行选择、变换或者组合等使得特征具有区分性。而非线性算法则牛逼点,可以建模复杂的分类面,从而能更好的拟合数据。

       那在我们选择了特征的基础上,哪个机器学习算法能取得更好的效果呢?谁也不知道。实践是检验哪个好的不二标准。那难道要苦逼到写五六个机器学习的代码吗?No,机器学习社区的力量是强大的,码农界的共识是不重复造轮子!因此,对某些较为成熟的算法,总有某些优秀的库可以直接使用,省去了大伙调研的大部分时间。

       基于目前使用python较多,而python界中远近闻名的机器学习库要数scikit-learn莫属了。这个库优点很多。简单易用,接口抽象得非常好,而且文档支持实在感人。本文中,我们可以封装其中的很多机器学习算法,然后进行一次性测试,从而便于分析取优。当然了,针对具体算法,超参调优也非常重要。

 

二、Scikit-learn的python实践

2.1、Python的准备工作

       Python一个备受欢迎的点是社区支持很多,有非常多优秀的库或者模块。但是某些库之间有时候也存在依赖,所以要安装这些库也是挺繁琐的过程。但总有人忍受不了这种繁琐,都会开发出不少自动化的工具来节省各位客官的时间。其中,个人总结,安装一个python的库有以下三种方法:

1)Anaconda

       这是一个非常齐全的python发行版本,最新的版本提供了多达195个流行的python包,包含了我们常用的numpy、scipy等等科学计算的包。有了它,妈妈再也不用担心我焦头烂额地安装一个又一个依赖包了。Anaconda在手,轻松我有!下载地址如下:http://www.continuum.io/downloads

2)Pip

       使用过Ubuntu的人,对apt-get的爱只有自己懂。其实对Python的库的下载和安装可以借助pip工具的。需要安装什么库,直接下载和安装一条龙服务。在pip官网https://pypi.python.org/pypi/pip下载安装即可。未来的需求就在#pip install xx 中。

3)源码包

       如果上述两种方法都没有找到你的库,那你直接把库的源码下载回来,解压,然后在目录中会有个setup.py文件。执行#python setup.py install 即可把这个库安装到python的默认库目录中。

2.2、Scikit-learn的测试

       scikit-learn已经包含在Anaconda中。也可以在官方下载源码包进行安装。本文代码里封装了如下机器学习算法,我们修改数据加载函数,即可一键测试:

[python] view plain copy
  1. classifiers = {'NB':naive_bayes_classifier,   
  2.                   'KNN':knn_classifier,  
  3.                    'LR':logistic_regression_classifier,  
  4.                    'RF':random_forest_classifier,  
  5.                    'DT':decision_tree_classifier,  
  6.                   'SVM':svm_classifier,  
  7.                 'SVMCV':svm_cross_validation,  
  8.                  'GBDT':gradient_boosting_classifier  
  9.     }  

train_test.py

[python] view plain copy
  1. #!usr/bin/env python  
  2. #-*- coding: utf-8 -*-  
  3.   
  4. import sys  
  5. import os  
  6. import time  
  7. from sklearn import metrics  
  8. import numpy as np  
  9. import cPickle as pickle  
  10.   
  11. reload(sys)  
  12. sys.setdefaultencoding('utf8')  
  13.   
  14. # Multinomial Naive Bayes Classifier  
  15. def naive_bayes_classifier(train_x, train_y):  
  16.     from sklearn.naive_bayes import MultinomialNB  
  17.     model = MultinomialNB(alpha=0.01)  
  18.     model.fit(train_x, train_y)  
  19.     return model  
  20.   
  21.   
  22. # KNN Classifier  
  23. def knn_classifier(train_x, train_y):  
  24.     from sklearn.neighbors import KNeighborsClassifier  
  25.     model = KNeighborsClassifier()  
  26.     model.fit(train_x, train_y)  
  27.     return model  
  28.   
  29.   
  30. # Logistic Regression Classifier  
  31. def logistic_regression_classifier(train_x, train_y):  
  32.     from sklearn.linear_model import LogisticRegression  
  33.     model = LogisticRegression(penalty='l2')  
  34.     model.fit(train_x, train_y)  
  35.     return model  
  36.   
  37.   
  38. # Random Forest Classifier  
  39. def random_forest_classifier(train_x, train_y):  
  40.     from sklearn.ensemble import RandomForestClassifier  
  41.     model = RandomForestClassifier(n_estimators=8)  
  42.     model.fit(train_x, train_y)  
  43.     return model  
  44.   
  45.   
  46. # Decision Tree Classifier  
  47. def decision_tree_classifier(train_x, train_y):  
  48.     from sklearn import tree  
  49.     model = tree.DecisionTreeClassifier()  
  50.     model.fit(train_x, train_y)  
  51.     return model  
  52.   
  53.   
  54. # GBDT(Gradient Boosting Decision Tree) Classifier  
  55. def gradient_boosting_classifier(train_x, train_y):  
  56.     from sklearn.ensemble import GradientBoostingClassifier  
  57.     model = GradientBoostingClassifier(n_estimators=200)  
  58.     model.fit(train_x, train_y)  
  59.     return model  
  60.   
  61.   
  62. # SVM Classifier  
  63. def svm_classifier(train_x, train_y):  
  64.     from sklearn.svm import SVC  
  65.     model = SVC(kernel='rbf', probability=True)  
  66.     model.fit(train_x, train_y)  
  67.     return model  
  68.   
  69. # SVM Classifier using cross validation  
  70. def svm_cross_validation(train_x, train_y):  
  71.     from sklearn.grid_search import GridSearchCV  
  72.     from sklearn.svm import SVC  
  73.     model = SVC(kernel='rbf', probability=True)  
  74.     param_grid = {'C': [1e-31e-21e-11101001000], 'gamma': [0.0010.0001]}  
  75.     grid_search = GridSearchCV(model, param_grid, n_jobs = 1, verbose=1)  
  76.     grid_search.fit(train_x, train_y)  
  77.     best_parameters = grid_search.best_estimator_.get_params()  
  78.     for para, val in best_parameters.items():  
  79.         print para, val  
  80.     model = SVC(kernel='rbf', C=best_parameters['C'], gamma=best_parameters['gamma'], probability=True)  
  81.     model.fit(train_x, train_y)  
  82.     return model  
  83.   
  84. def read_data(data_file):  
  85.     import gzip  
  86.     f = gzip.open(data_file, "rb")  
  87.     train, val, test = pickle.load(f)  
  88.     f.close()  
  89.     train_x = train[0]  
  90.     train_y = train[1]  
  91.     test_x = test[0]  
  92.     test_y = test[1]  
  93.     return train_x, train_y, test_x, test_y  
  94.       
  95. if __name__ == '__main__':  
  96.     data_file = "mnist.pkl.gz"  
  97.     thresh = 0.5  
  98.     model_save_file = None  
  99.     model_save = {}  
  100.       
  101.     test_classifiers = ['NB''KNN''LR''RF''DT''SVM''GBDT']  
  102.     classifiers = {'NB':naive_bayes_classifier,   
  103.                   'KNN':knn_classifier,  
  104.                    'LR':logistic_regression_classifier,  
  105.                    'RF':random_forest_classifier,  
  106.                    'DT':decision_tree_classifier,  
  107.                   'SVM':svm_classifier,  
  108.                 'SVMCV':svm_cross_validation,  
  109.                  'GBDT':gradient_boosting_classifier  
  110.     }  
  111.       
  112.     print 'reading training and testing data...'  
  113.     train_x, train_y, test_x, test_y = read_data(data_file)  
  114.     num_train, num_feat = train_x.shape  
  115.     num_test, num_feat = test_x.shape  
  116.     is_binary_class = (len(np.unique(train_y)) == 2)  
  117.     print '******************** Data Info *********************'  
  118.     print '#training data: %d, #testing_data: %d, dimension: %d' % (num_train, num_test, num_feat)  
  119.       
  120.     for classifier in test_classifiers:  
  121.         print '******************* %s ********************' % classifier  
  122.         start_time = time.time()  
  123.         model = classifiers[classifier](train_x, train_y)  
  124.         print 'training took %fs!' % (time.time() - start_time)  
  125.         predict = model.predict(test_x)  
  126.         if model_save_file != None:  
  127.             model_save[classifier] = model  
  128.         if is_binary_class:  
  129.             precision = metrics.precision_score(test_y, predict)  
  130.             recall = metrics.recall_score(test_y, predict)  
  131.             print 'precision: %.2f%%, recall: %.2f%%' % (100 * precision, 100 * recall)  
  132.         accuracy = metrics.accuracy_score(test_y, predict)  
  133.         print 'accuracy: %.2f%%' % (100 * accuracy)   
  134.   
  135.     if model_save_file != None:  
  136.         pickle.dump(model_save, open(model_save_file, 'wb'))  

四、测试结果

       本次使用mnist手写体库进行实验:http://deeplearning.net/data/mnist/mnist.pkl.gz。共5万训练样本和1万测试样本。

       代码运行结果如下:

[python] view plain copy
  1. reading training and testing data...  
  2. ******************** Data Info *********************  
  3. #training data: 50000, #testing_data: 10000, dimension: 784  
  4. ******************* NB ********************  
  5. training took 0.287000s!  
  6. accuracy: 83.69%  
  7. ******************* KNN ********************  
  8. training took 31.991000s!  
  9. accuracy: 96.64%  
  10. ******************* LR ********************  
  11. training took 101.282000s!  
  12. accuracy: 91.99%  
  13. ******************* RF ********************  
  14. training took 5.442000s!  
  15. accuracy: 93.78%  
  16. ******************* DT ********************  
  17. training took 28.326000s!  
  18. accuracy: 87.23%  
  19. ******************* SVM ********************  
  20. training took 3152.369000s!  
  21. accuracy: 94.35%  
  22. ******************* GBDT ********************  
  23. training took 7623.761000s!  
  24. accuracy: 96.18%  

       在这个数据集中,由于数据分布的团簇性较好(如果对这个数据库了解的话,看它的t-SNE映射图就可以看出来。由于任务简单,其在deep learning界已被认为是toy dataset),因此KNN的效果不赖。GBDT是个非常不错的算法,在kaggle等大数据比赛中,状元探花榜眼之列经常能见其身影。三个臭皮匠赛过诸葛亮,还是被验证有道理的,特别是三个臭皮匠还能力互补的时候!

       还有一个在实际中非常有效的方法,就是融合这些分类器,再进行决策。例如简单的投票,效果都非常不错。建议在实践中,大家都可以尝试下。

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