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关键词:双聚类算法;基因表达谱系分析;Cheng and Church算法
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An Improved Biclustering Algorithm and Its Application to Gene Expression Spectrum Analysis
摘要
Cheng和Church算法是双聚类算法中的一种重要方法。 本文改进了Cheng和Church算法第二阶段扩展空间的过程,并讨论了两个重要参数的选择。基因表达谱分析中使用改进算法的结果表明,与Cheng和Church算法相比,聚类结果的质量明显提高,挖掘表达模型的效果更好,数据在条件上具有较强的波动一致性,而计算时间并没有明显增加。
介绍
基因表达谱分析是生物信息学领域的一个重要课题。它的任务是从数据矩阵中找到卓越的结构。结构类型包括整体模型和局部模型。聚类分析作为分析基因表达数据的有效工具,被广泛应用于基因表达谱分析(1)、基因组研究、生物调控网络(2)、药物过滤、新药开发、临床疾病诊断(3、4)等多个领域。聚类分析的基本