mne进行ica分析

最近在做有关的项目,根据mne文档写的内容 就不写注释了。这里我用的是csv的数据直接读取。

import numpy as np
import mne
import matplotlib.pyplot as plt
from mne.preprocessing import ICA
from mne.time_frequency import tfr_morlet
import pandas as pd
from itertools import chain

# Read the CSV file as a NumPy array 需要电信号
data1 = []
for i in range(1, 23):
    data = pd.read_csv('data.csv', usecols=[str(i)])
    list1 = data.values.tolist()
    final_list = list(chain.from_iterable(list1))
    data1.append(final_list)

# Some information about the channels
# ch_names = []
# for i in range(1, 20):
#     ch_names.append("ch " + str(i))
ch_names=['Fz', 'FC3', 'FC1', 'FCz', 'FC2', 'FC4', 'C5', 'C3', 'C1', 'Cz', 'C2', 'C4', 'C6', 'CP3', 'CP1','CPz', 'CP2', 'CP4', 'P1', 'Pz', 'P2', 'POz']


# Sampling rate of the Nautilus machine 采样频率
sfreq = 100  # Hz 


# Create the info structure needed by MNE
info = mne.create_info(ch_names, sfreq,ch_types='eeg') 

# Finally, create the Raw object
raw = mne.io.RawArray(data1, info)

# #电极信息
montage = mne.channels.make_standard_montage("standard_1020")
raw.set_montage(montage)



#ICA
ica = mne.preprocessing.ICA(n_components=22, random_state=97, max_iter=800)
ica.fit(raw)
ica.exclude = [1, 2,3]  # details on how we picked these are omitted here
ica.plot_properties(raw, picks=ica.exclude)
plt.show()

生成的图 

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### 回答1: MNE是一款用于神经信号处理的Python库,支持许多不同的数据类型和分析方法。其中之一是独立成分分析(ICA),它可以用于分离混合在一起的信号,并独立地分离它们的成分。 如果想要查看MNE库中ICA图,可以采用以下方法: 首先,需要加载相关数据。可以使用MNE库中的例子数据或者自己的数据。加载数据后,可以运行ICA算法,将混合的信号分离成单独的成分。MNE库提供了ICA算法的实现,可以使用FastICA或InfoMax算法。 在运行ICA算法之后,可以使用plot_components函数来查看成分图。这个函数会显示每个成分的时间序列和功率谱密度。成分图通常会给出每个成分的激活模式,即在哪些电极上观察到较强的信号。这个信息可以用于研究脑功能区域之间的相互作用。 除了成分图之外,还可以使用topomap函数来绘制每个成分的电极拓扑图。这个图形将各个成分的电极拓扑图放在同一个图表中,以便比较它们之间的相似性和差异性。 总之,在MNE库中查看ICA图往往需要结合使用多个不同的函数和可视化工具,在处理数据时需要根据特定的实验设计和分析需求进行选择。 ### 回答2: 在 mne 库中,使用独立成分分析 (ICA) 进行信号分解可以帮助我们识别和去除噪声成分,提高信号的清晰度和易读性。MNE 提供了多种方式来查看 ICA 图,下面我们将逐个介绍这些方法。 1. ica.plot_components():这个函数可以用来绘制独立成分和相应的时间课,以供视觉分析。可以使用鼠标左键和右键分别缩放和平移时间和幅度的轴线,进一步查看各个独立成分和它们的时域特征。 2. ica.plot_sources():这个函数可以用来查看 ICA 分解后的信号的时间序列。使用鼠标左键和右键可以分别调整时间轴和幅度轴,观察信号的整体趋势和波动。在此函数中,我们还可以使用参数 block=True,将整个时间段的信号连续播放出来,以更好地观察其时域特征。 3. ica.plot_properties():这个函数可以用来绘制独立成分的额外信息,包括成分的功率谱密度、互相关性和延迟信息。这些信息可以帮助我们更好地理解各个成分的频域特征和时延特性,以便更好地选择有用的成分进行后续分析。 以上就是在 mne 库中查看 ICA 图的三种方法。需要注意的是,正确理解和分析 ICA 图需要强大的领域专业知识和相关经验,对于初学者来说常常需要借助专业教材和辅导,才能更好地掌握相关技能。
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