用MRIcroN将分割图和原图的重叠显示

一个人研究血管分割的心酸历程,不断的探索,记录自己已解决的一些问题。

一般经过分割模型分割出来的图像的信息和原图的很多信息不是匹配的,如果此时想要将模型的分割图和原图重叠一起,查看分割的效果,是看不出来的。因此,需要要分割图和原图的一些信息进行匹配。

import SimpleITK as sitk
image=sitk.ReadImage("./CS-Net-master/data/predict_crop/1.nii.gz")
origin=image.GetOrigin()
spacing=image.GetSpacing()
Direction=image.GetDirection()

image1=sitk.ReadImage("./CS-Net-master/pred/MRA/pred/1_pred.nii.gz")
image1.SetOrigin(origin)
image1.SetSpacing(spacing)
image1.SetDirection(Direction)
sitk.WriteImage(image1,"./CS-Net-master/pred/MRA/pred/1_1pred.nii.gz")

其中,image是原图,image1是原图的分割图,通常我们需要将原图的origin,spacing,direction这些值赋予分割图,这样就可以逐层查看自己的分割图和原图是否重叠。

下面是分割效果的展现图。

 

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