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原创 colorspace.c:2:10: fatal error: ctype.h: No such file or directory

【代码】colorspace.c:2:10: fatal error: ctype.h: No such file or directory。

2024-03-29 10:05:34 89 1

原创 icommands 玉米282群体下载

【代码】icommands 玉米282群体下载。

2024-03-26 11:17:39 387

原创 RNA-seq

表达矩阵:1.芯片2.rna-seqrna seq:bulk vs single cell for heterogenous异质性。

2023-08-21 18:04:04 97 1

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本例使用三代组装的玉米NAM群体为例。通过AnchorWave进行全基因组比对,通过gatk进行变异检测。通过tassel进行格式转换。

2023-04-04 16:59:03 607

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2022-12-30 20:41:35 139

原创 重测序resequencing

intere

2022-08-29 14:42:04 1543

原创 R语言必备知识

R语言快速入门

2022-08-26 10:10:27 903

原创 使用python进行序列的GC含量的统计

使用python进行序列的GC含量的统计

2022-08-26 09:06:57 1561

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学会这些代码你就入门了

2022-08-25 22:10:43 215

原创 进化之自然选择

自然选择中强选择压和进化能力的关系

2022-08-23 08:32:08 578

原创 Linux 入门常见命令大全-初学者必看

本文是我在学习linux过程学习到的相关基本命令行。linux系统有两个常见应用界面CentOS和Ubuntu。

2022-08-16 19:19:33 4032

原创 anchorwave进行复杂基因组比对(3)

anchorwave以玉米B73和Mo17为例对存在倒位的基因组进行全基因组比对。与其他主流软件相比,具有较好的敏感性和准确率。

2022-08-16 15:36:49 915

原创 anchorwave进行复杂基因组比对(2)

本文使用anchorwave以两个不同品种的拟南芥为例对不存在全基因组加倍,转座子插入,倒位等染色体变异基因组间进行全基因组比对和变异检测。

2022-08-15 19:39:02 695

原创 anchorwave进行复杂基因组比对(1)

anchorwave能够进行敏感且准确的基因组比对。本文以斑马鱼和金鱼为例进行基因组比对,他们之间存在全基因组加倍,染色体重排等,anchorwave表现出较好的比对效果。

2022-08-15 15:00:31 1218

原创 anchorwave安装流程

anchorwave安装的3种方法。1.使用源代码2.使用conda3.使用docker

2022-08-15 10:17:02 412

翻译 基因组比对神器anchorwave的流程

全基因组比对软件anchorwave,它对植物基因组非常敏感和准确,同时也适用于动物和人,能够同时识别短的和长的indel,进行比对时需要设置WGD次数,所以重复序列基本不会错误。

2022-08-15 09:46:33 712

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