Rstudio server

1.打开shell命令行输入sudo apt-get install r-base命令安装R
2.安装RStudio服务器：打开shell命令行，依次输入以下命令并执行
sudo apt-get install gdebi-core
WGET https://download2.rstudio.org/server/jammy/amd64/rstudio-server-2023.06.2-561-amd64.deb
sudo gdebi rstudio-server-2023.06.2-561-amd64.deb
成功测试：shell命令行中输入：rstudio-server status即可查看rstudio的状态。
3.进行R相关包的安装：打开shell命令行，输入R进入R语言环境后输入以下命令。
install.packages(“ggplot2”)
install.packages(“BiocManager”)
BiocManager::install(“SingleCellExperiment”)
BiocManager::install(“scater”)
成功测试：>library(包名）不报错即成功。
4.可能报错：
安装SingleCellExperiment出现Rcurl包安装出错
解决方案：使用 install.packages（“RCurl”）安装出现cannot find curl-config—》q()退出R，在Terminal下使用命令sudo apt-get install libcurl4-openssl-dev安装(如果出现软件⽆法定位先更新⼀下：sudo apt-get update）—》再“R”进⼊R后安装SingleCellExperiment。
缺少libssl1.0.0｜libssl1.0.2｜liblibssl1.1
解决方案： 先安装libssl1.0.0｜libssl1.0.2，打开shell命令行输入以下命令
wget http://security.ubuntu.com/ubuntu/pool/main/o/openssl/libssl1.0.0_1.0.2g-1ubuntu4.20_amd64.deb
sudo dpkg -i libssl1.0.0_1.0.2g-1ubuntu4.20_amd64.deb
sudo gdebi rstudio-1.1.414-amd64.deb
再安装liblibssl1.1，输入以下命令
wget https://www.openssl.org/source/openssl-1.1.1o.tar.gz
tar -xzvf openssl-1.1.1o.tar.gz
cd openssl-1.1.1o
./config
make
sudo make install
sudo cp ./libssl.so.1.1 /lib/x86_64-linux-gnu
sudo cp ./libcrypto.so.1.1 /lib/x86_64-linux-gnu
3实现宿主机访问虚拟机

Ubuntu系统设置-网络-网卡1：连接方式设为“网络地址转换（NAT）”；高级-端口转发，增加22和8787接口。
VirtualBox—》⽹络—-〉增加“仅Host-Only”⽹络。
Ubuntu设置—》⽹络—-〉⽹卡2-》连接⽅式：”仅主机⽹络”—名称为刚刚新建的Host-Only⽹卡。
宿主机的控制⾯板—》⽹络和Internet—〉⽹络连接—》以太⽹2(对应VirtuaBox的Host-Only…)—>TCP/IPv4—>IP地址和DNS服务器地址设置。
进⼊虚拟机Ubuntu系统打开终端—》使⽤sudo apt install net-tools后使⽤ifconfig命令查看ip地址—〉通过宿主机的cmd即可ping通该ip。
进⼊虚拟机Ubuntu系统打开终端—》使⽤sudo service ssh status 查看 ssh.service状态—〉如果是”could not be found”，使⽤命令 sudo apt install openssh-server—->使⽤命令启动ssh服务：sudo service ssh start——>现在即可在宿主机cmd通过ssh ⽤户名@ip 连到服务器。
进⼊虚拟机Ubuntu系统打开终端—》rstudio-server start 打开rstudio-server—〉宿主
机⽤Ubuntu系统ifconfig查到的ip地址加8787在浏览器登陆。
ubuntulinuxr语言