【数据分析】分形结构在生物医学时间序列中的应用:多重分形去趋势波动分析 (MFDFA) Matlab复现

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🔥 内容介绍

摘要:分形结构广泛存在于生物医学时间序列中,反映了各种生理现象。多重分形谱能够识别时间序列中波动幅度大小不同时段内分形结构的差异。本教程将介绍多重分形去趋势波动分析 (MFDFA),该方法可以估计生物医学时间序列的多重分形谱。教程将通过一个交互式的 Matlab 会话逐步讲解 MFDFA 的实现步骤。

引言

分形是自然界中普遍存在的几何结构,它具有自相似性,即局部结构在不同尺度上重复出现。生物医学时间序列,如心电图 (ECG)、脑电图 (EEG) 和呼吸信号,也表现出分形特征,这反映了生理系统在不同时间尺度上的复杂性和自组织性。

传统的单分形方法,例如去趋势波动分析 (DFA),仅能描述时间序列的整体分形性质。然而,许多生物医学信号表现出非平稳性,其分形特性随时间变化。例如,心跳间期变异性 (HRV) 的分形结构可能在睡眠期间不同于清醒期间。为了捕捉这种变化,需要更精细的分形分析方法,即多重分形分析 (MFDFA)。

MFDFA 是一种能够识别时间序列中波动幅度大小不同时段内分形结构差异的方法。它通过计算不同尺度下的波动函数来估计多重分形谱。多重分形谱是一个连续函数,它描述了时间序列在不同尺度上的分形特性。

MFDFA 方法

MFDFA 算法的主要步骤如下:

  1. 预处理: 对时间序列进行预处理,例如去除趋势和噪声。

  2. 分段: 将时间序列分成长度为 N 的相等段。

  3. 去趋势: 对每个段进行多项式拟合,并用拟合后的多项式对原始数据进行去趋势。

  4. 波动计算: 对去趋势后的时间序列计算波动函数 F(s),其中 s 是尺度。

  5. 回归分析: 利用最小二乘法拟合波动函数 F(s) 与尺度 s 之间的对数线性关系,得到斜率 h(q)。

  6. 多重分形谱: 通过改变 q 值,重复步骤 5,得到一个关于 q 的函数 h(q),即多重分形谱。

以下代码框展示了 MFDFA 的基本实现:

% 加载时间序列数据
data = load('time_series.mat');
signal = data.signal;

% 设置参数
order = 2; % 多项式拟合阶数
q = [-4:0.2:4]; % q 值范围
s = 2.^[4:10]; % 尺度范围

% 进行 MFDFA 分析
[h,q] = MFDFA(signal,order,q,s);

% 绘制多重分形谱
plot(q,h);
xlabel('q');
ylabel('h(q)');
title('多重分形谱');

最佳实践

在实际应用中,MFDFA 的最佳实践包括:

  1. 数据预处理: 对数据进行适当的预处理,例如去除趋势、噪声和离群点,以确保分析结果的准确性。

  2. 参数选择: 选择适当的多项式拟合阶数、q 值范围和尺度范围,以满足时间序列的具体特征。

  3. 结果解释: 对多重分形谱进行解释,分析不同 q 值下 h(q) 的变化趋势,从而识别时间序列在不同尺度上的分形特性。

结论

MFDFA 是一种强大的工具,能够识别生物医学时间序列中不同时间尺度上的分形结构差异。本教程通过交互式 Matlab 代码框和最佳实践指南,为读者提供了实现和解释 MFDFA 结果的便捷方法。相信通过本教程的学习,读者能够更好地理解 MFDFA 的原理和应用,并将其应用于自己的生物医学研究中。

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