8. 基础知识
此部分描述了如何使用 LAMMPS 为用户和开发人员执行各种任务。术语表页面还列出了 MD 术语,以及相应 LAMMPS 手册页的链接。 LAMMPS 源代码分发的 examples
目录中包含的示例输入脚本以及示例脚本页面上突出显示的示例输入脚本还展示了如何设置和运行各种模拟。
8.1.通用基础知识
8.2. 设置入门
8.3. 分析入门
8.4. 力场入门
8.4.1. CHARMM、AMBER、COMPASS 和 DREIDING 力场
力场由两部分组成:定义力场的公式和用于特定系统的系数。这里我们只讨论 LAMMPS 中实现的公式,这些公式对应于 CHARMM、AMBER、COMPASS 和 DREIDING 力场中常用的公式。设置系数可以通过 read_data 命令从输入数据文件中的特殊部分完成,也可以在输入脚本中使用