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原创 使用SnpEff 对SNP结果进行分析
SnpEff is a variant annotation and effect prediction tool. It annotates and predicts the effects of variants on genes 详细的说明请阅读:http://snpeff.sourceforge.net/SnpEff_manual.html一, 安装:首先在家目录下, 下载安装包wget h
2017-08-11 21:50:37 9127
原创 体外应用Cas9系统实现对上百kb的基因组片段的靶向克隆
2015年的时候看到这样篇论文,了解到Cas9可以进行体外酶切。清华大学生命科学学院朱听研究员课题组在《自然-通讯》上在线发表了题为《CATCH技术实现大型基因簇一步法靶向克隆》(Cas9-Assisted Targeting of Chromosome segments CATCH enables one-step targeted cloning of large gene clusters)的
2017-08-07 09:45:04 1755
原创 如何获取一个基因家族的所有小麦基因
如何获取一个基因家族的所有小麦基因昨天有同学问我如何获得谷子中一个基因家族的所有基因。谷子已经测过序,获得起来还是比较简单。想要获得一个基因组家族的所有基因,方法很多。比方说,IWGSCv1.0的基因功能注释文件里就可以直接搜索相关关键词或者蛋白domain的ID等获取。结合基因家族序列特点,合理选择获取方法。有的基因家族成员之间保守性不好,可能官方给的注释里边不是全。下面说一下如何在线获取基于TG
2017-08-03 09:43:34 15622 3
空空如也
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