医疗图像坐标转换问题总结

对于3D0slicer上的数据，其dimention表示的是ijk坐标系下的。

例如如上图，数据的dimention是480480320。也就是i,j,k这个样子。那么i,j,k坐标系如何转换呢，我觉得要找个数据看一看，以上的数据，通过ijk变成ras后，显示如下：

那么可以得出i坐标轴，对应的应该就是R坐标轴。当对数据进行裁剪的时候，我们还是应该考虑转为IJK坐标系，也就是说我想裁剪左侧的下颌管位置，那么在I坐标轴下，其方向从原点到
imageNrrd = sitk.ReadImage(path)
print(imageNrrd.GetSize())
itkImage_arr = sitk.GetArrayFromImage(imageNrrd)
print(itkImage_arr.shape)
当用numpy获取到数组之后，这个维度就发生变化了。反过来了。